在.py中导入flask-migrate,flask-script不出错，可以找到。但是在pycharm下方的Terminal中使用命令：python manage.py db migrate，就出错，说没有这两个包。
在百度上找了好久，就是找不到我的出此错的原因，么的办法，只能自己找原因。我试过博客https://blog.csdn.net/arnolan/article/details/84893088的办法，发现问题：找包的路径不是我安装的conda虚拟环境。还试过在terminal用pip重装flask-script和flask-migrate两个包，还是不行。环境变量是我自己装的python3.6.8也不是anaconda的python环境变量，环境变量换成anaconda也试了，不行。
最后实在不可奈何，只能重新建虚拟环境，用我自己装的python建立，不适用conda建虚拟环境。打开cmd命令窗口，安装virtualenv，通过virtualenv来创建虚拟环境
pip install virtualenv
我想把虚拟环境单独放在一个文件夹，故在d盘下新建文件夹python-env，把命令窗口切换到该文件夹下，用cd命令可以，也可以在该文件夹下打开cmd，如下图
然后输入命令
virtualenv -p D:Python36_64python.exe gxq # 路径是想建立什么版本的python的路径，我这里用到我自己安装的python。gxq是虚拟环境的名称
这样虚拟环境就建立好了，在pycharm中可以选择该虚拟环境，并且flask-migrate和flask-script也有了，可以在file->settings->project:项目名称->project interpreter中，点击+号，搜索flask-migrate和flask-script，点击安装即可。这是解决我的问题的办法，虽说说不清为啥，但隐隐感觉是conda的虚拟环境变量装不了这两个包的原因，毕竟我是通过以下命令安装的
conda install flask-migrate
conda install flask-script
用这两行命令，还时好时坏，晚上的时候能装上，白天就费劲，但是问题好歹是解决了。如果读者有好的办法，请在下方评论，我们一起交流，一起进步!