解决:安装R包时,经常提示“package ‘readr’ is not available (for R version 3.5.1)”的问题

    1. 安装R包时,我一般采用两种方法:

  方法1:

     install.packages("xxx");

  方法2:

    source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
    biocLite("readr")

即便用这两种方法,仍然会出现问题“无法打开URL'https://mirrors.eliteu.cn/CRAN/src/contrib/PACKAGES',无法打开URL'https://mirrors.eliteu.cn/CRAN/src/contrib/PACKAGES'的问题。

    参考链接https://stackoverflow.com/questions/25721884/how-should-i-deal-with-package-xxx-is-not-available-for-r-version-x-y-z-wa,给出了一个方法: install.packages('xxx',repos='http://cran.us.r-project.org')。我尝试了此方法,it`s worked!

    该链接中有对这种错误的详细解释,有时间的时候再详细看看。

也可参考:https://www.haktansuren.com/installing-r-package-fixing-package-xxx-is-not-available-for-r-version-x-y-z-warning/

  方法3:

    执行install.packages('BiocManager'),安装BiocManager。

    问题:执行BiocManager::install('clusterProfiler'),出现error: 'BiocParallel' did not register default BiocParallelParams:

    解决:

      remove.packages("BiocInstaller")

      BiocManager::install('BiocParallel')

      参考网址中的方法:source("https://bioconductor.org/biocLite.R")   或者biocLite("devtools"),都执行失败。

      我理解,现在安装R包,应该用BiocManager了。用之前的方法不好用了。所以,我用BiocManager重新安装BiocParallel后,OK。

      还提示dplyr包版本低的问题,用BiocManager重新安装给包后,问题解决。

    原因:

    注意事项:

      在01机器上安装的该R包。ASUS机器提示有问题。

        

    参考资料:

      https://support.bioconductor.org/p/95306/

ASUS机器上,安装GSVA包,方法:

      

原文地址:https://www.cnblogs.com/zypiner/p/10749916.html