动态时间规整-DTW简介

动态时间规整 ,Dynamic Time Warping,简称 DTW;

它是衡量 两个时间序列 之间相似性的 一种度量方式,特点是 序列的长度可以不同;

其主要应用于 语音识别 领域;

算法起源

我们知道相似性度量有很多种方式,那为什么还需要 DWT 这种算法?

举个 语音识别 的例子,比如我们早上跑操要喊 1234,我们会把不同的数字发音拖长,用数字形象的表示为

1 1 2 2 3 4  // 1 2 发音拖长

1 2 3 3 4 4  // 3 4 发音拖长

实际上 这句话 都是 1234,是一个意思,语音识别结果应该相同,或者说相似性很高;

但是如果用传统的度量方式,比如曼哈顿距离,1-1 + 1-2 + 2-3 + 2-3 + 3-4 + 4-4 = -4,取绝对值,距离为 4,显然相似性不是很高;

如果我们加入语音的特点,把 1 的发音 和 1 拖长的发音 做距离计算,就可以得到 距离为 0,相似性很高;

这种 把 某个时间点与 另一时刻多个连续的时间点 对应的 方法称为 时间规整

DTW 通过把不同长度的时间序列进行延伸和缩短,来计算两个时间序列性之间的相似性:

核心思想

上面说的很容易懂,那问题来了,如何延申缩短?把某一时刻的数据与哪些时刻的多个连续数据做对应?

首先,DTW 是一种相似性度量方式,难点在于点与点之间存在无限多种可能得对应关系,最直接的解决方式就是穷举所有的对应关系,找到距离最小的对应关系,此时的距离作为他们的相似性度量;

用数学表示这个思路:

综上,DTW的核心思想如下:

1. DTW 并没有做所谓的拉伸和压缩,它的本质是做点与点之间的匹配,通过一对多、多对一的匹配实现了拉伸和压缩的效果

2.  DTW核心是找到一个最好的点与点的对应关系,这个过程可形象理解为路径规划问题,而路径规划问题有很多成熟的解决方案,如动态规划

动态规划 和 路径规划的问题,可自行研究,我也会在其他章节进行说明

实现方法

具体实现步骤如下

Python Demo

假设我们有三个时间序列,分别是

ts_a = [1,5,8,10,56,21,32,8]

ts_b = [1,5,8,10,23,56,21,32,8]

ts_c = [1,3,6,9,16,29,31,32,33]

ts_a与ts_b和ts_c的长度不一样,现在需要知道ts_a与ts_b和ts_c哪个更相似,通过观察,我们可以清楚的看出ts_a与ts_b的相似度更高。使用DTW相似度解决该问题的代码如下:

import sys
import numpy as np


def cal_dtw_distance(ts_a, ts_b):
    """Returns the DTW similarity distance between two 2-D
    timeseries numpy arrays.

    Arguments
    ---------
    ts_a, ts_b : array of shape [n_samples, n_timepoints]
        Two arrays containing n_samples of timeseries data
        whose DTW distance between each sample of A and B
        will be compared

    d : DistanceMetric object (default = abs(x-y))
        the distance measure used for A_i - B_j in the
        DTW dynamic programming function

    Returns
    -------
    DTW distance between A and B
    """
    d=lambda x, y: abs(x - y)
    max_warping_window = 10000

    # Create cost matrix via broadcasting with large int
    ts_a, ts_b = np.array(ts_a), np.array(ts_b)
    M, N = len(ts_a), len(ts_b)
    cost = sys.maxsize * np.ones((M, N))

    # Initialize the first row and column
    cost[0, 0] = d(ts_a[0], ts_b[0])
    for i in range(1, M):
        cost[i, 0] = cost[i - 1, 0] + d(ts_a[i], ts_b[0])

    for j in range(1, N):
        cost[0, j] = cost[0, j - 1] + d(ts_a[0], ts_b[j])

    # Populate rest of cost matrix within window
    for i in range(1, M):
        for j in range(max(1, i - max_warping_window),
                       min(N, i + max_warping_window)):
            choices = cost[i - 1, j - 1], cost[i, j - 1], cost[i - 1, j]
            cost[i, j] = min(choices) + d(ts_a[i], ts_b[j])

    # Return DTW distance given window
    return cost[-1, -1]

if __name__ == "__main__":
    # 案例:判断ts_a与ts_b和ts_c哪个更相似
    
    ts_a = [1,5,8,10,56,21,32,8]
    ts_b = [1,5,8,10,23,56,21,32,8]
    ts_c = [1,3,6,9,16,29,31,32,33]
    
    # 调用cal_dtw_distance计算dtw相似度
    dtw_ab = cal_dtw_distance(ts_a, ts_b)
    dtw_ac = cal_dtw_distance(ts_a, ts_c)
    
    print("ts_a与ts_b的dtw相似度为 %2.f,
ts_a与ts_c的dtw相似度为 %2.f。" % (dtw_ab, dtw_ac))
    
    if dtw_ab < dtw_ac:
        print("ts_a与ts_b 更相似!")
    else:
        print("ts_a与ts_c 更相似!")

输出

ts_a与ts_b的dtw相似度为 13,
ts_a与ts_c的dtw相似度为 71。
ts_a与ts_b 更相似!


参考资料:

https://zhuanlan.zhihu.com/p/43247215  动态时间规整(DTW)算法简介

https://blog.csdn.net/manjhOK/article/details/80481360  DTW算法

https://blog.csdn.net/fewjioqpfjeiowph/article/details/83743573  DTW基本原理

原文地址:https://www.cnblogs.com/yanshw/p/14305610.html