Hadoop记录-hadoop集群常见问题汇总

【问题1】HBase Shell:ERROR: org.apache.hadoop.hbase.IPc.ServerNotRunningYetException: Server is not running yet
原因:hadoop处于safe mode
hadoop dfsadmin -safemode get 查看hadoop当前启动状态是否为safe mode
hadoop dfsadmin -safemode leave 退出

【问题2】Rowkey设计问题

现象
打开HBase的Web端,发现HBase下面各个RegionServer的请求数量非常不均匀,第一个想到的就是HBase的热点问题,上面是HBase下某张表的region请求分布情况,从中我们明显可以看到,部分region的请求数量为0,而部分的请求数量可以上百万,这是一个典型的热点问题。

原因
HBase出现热点问题的主要原因无非就是rowkey设计的合理性,像上面这种问题,如果rowkey设计得不好,很容易出现,比如:用时间戳生成rowkey,由于时间戳在一段时间内都是连续的,导致在不同的时间段,访问都集中在几个RegionServer上,从而造成热点问题。

解决
知道了问题的原因,对症下药即可,联系应用修改rowkey规则,使rowkey数据随机均匀分布

建议

对于HBase来说,rowkey的范围划定了RegionServer,每一段rowkey区间对应一个RegionServer,我们要保证每段时间内的rowkey访问都是均匀的,所以我们在设计的时候,尽量要以hash或者md5等开头来组织rowkey

【问题3】Region重分布
现象
HBase的集群是在不断扩展的,分布式系统的最大好处除了性能外,不停服横向扩展也是其中之一,扩展过程中有一个问题:每次扩展的机器的配置是不一样的,一般,后面新加入的机器性能会比老的机器好,但是后面加入的机器经常被分配很少的region,这样就造成了资源分布不均匀,随之而来的就是性能上的损失

每台RegionServer上的请求极为不均匀,多的好几千,少的只有几十

原因
资源分配不均匀,造成部分机器压力较大,部分机器负载较低,并且部分Region过大过热,导致请求相对较集中。

解决
迁移部分老的RegionServer上的region到新加入的机器上,使每个RegionServer的负载均匀。通过split切分部分较大region,均匀分布热点region到各个RegionServer上。

对比前后两张截图我们可以看到,Region总数量从1336增加到了1426,而增加的这90个region就是通过split切分大的region得到的。而对region重新分布后,整个HBase的性能有了大幅度提高。

建议
Region迁移的时候不能简单开启自动balance,因为balance主要的问题是不会根据表来进行balance,HBase的自动balance只会根据每个RegionServer上的Region数量来进行balance,所以自动balance可能会造成同张表的region会被集中迁移到同一个台RegionServer上,这样就达不到分布式的效果。

基本上,新增RegionServer后的region调整,可以手工进行,尽量使表的Region都平均分配到各个RegionServer上,另外一点,新增的RegionServer机器,配置最好与前面的一致,否则资源无法更好利用。

对于过大,过热的region,可以通过切分的方法生成多个小region后均匀分布(注意:region切分会触发major compact操作,会带来较大的I/O请求,请务必在业务低峰期进行)
【问题4】JVM参数调整

GC问题导致HBase整个系统的请求下降,通过适当调整JVM参数的方式,解决HBase RegionServer的GC问题。

export HBASE_REGIONSERVER_OPT="-Xmx8g -Xms8g -Xmn128m -XX:+UseParNewGC -XX:UseConcMarkSweepGC -XX:CMSInitiatingOccupancyFraction=70 -verbose:gc -XX:+printGCDetails -XX:+PrintGCTimeStamps -Xloggc:${HBASE_HOME}/logs/gc-${hostname}-hbase.log

建议
对于HBase来说,本身不存在单点故障,即使宕掉1,2台RegionServer,也只是使剩下几台的压力有所增加,不会导致整个集群服务能力下降很多。但是,如果其中某台RegionServer出现Full GC问题,那么这台机器上所有的访问都会被挂起,客户端请求一般都是batch发送的,rowkey的随机分布导致部分请求会落到该台RegionServer上,这样该客户端的请求就会被阻塞,导致客户端无法正常写数据到HBase。所以,对于HBase来说,宕机并不可怕,但长时间的Full GC是比较致命的,配置JVM参数的时候,尽量要考虑避免Full GC的出现。
【问题5】堆内存溢出的问题

java.lang.OutOfMemoryError
从错误本身可以发现是堆错误,很明显是设置的值太小而导致这样错误。
在hadoop开始配置的时候,在hadoop/etc/hadoop/目录下的hadoop-env.sh文件中
export HADOOP_HEAPSIZE=
是被注释掉的,查看上面的注释,这个值默认为1000,单位为Mb
这里去掉注释,修改为4000,需要注意的是这里要根据内存大小来选择值
export HADOOP_HEAPSIZE=4000

export HBASE_HEAPSIZE=1024
【问题6】drop表

drop 表后,会现 hadoop.hbase.catalog.MetaReader - No serialized HRegionInfo in keyvalues的警告,通过命令修复:

 hbase hbck  -fixEmptyMetaCells

 【问题7】Region Server 意外退出

1.1 背景
报错信息如下:

ERROR org.apache.hadoop.hbase.regionserver.HRegionServer: ZooKeeper session expired
之后, regionserver就退出了。

对于一个 reigonserver, 它需要将自己注册到 Zookeeper 上 master 的 Znode 上。这样的目的,是当master 宕机或者新的master启动的时候,能及时收到通知。对于 regionserver来说,维持和 Zookeeper 的联系是非常重要的。因为 regionserver 需要定期的将心跳包发给 master server。如果 regionserver 不能及时的知道 master 的改变,就会导致 regionserver 和 master 失去联系,而成为一个僵死的进程。
于是,在默认情况下,regionserver 遇到这种情况,就选择退出。

1.2 原因
为什么 regionserver 和Zookeeper的session expired? 可能的原因有

网络不好
Java full GC, 这会 block 所有的线程。如果时间比较长,也会导致 session expired
1.3 解决办法
将 Zookeeper 的 timeout 时间加长
<property>
<name>zookeeper.session.timeout</name>
<value>120000</value>
</property>
配置“hbase.regionserver.restart.on.zk.expire” 为true
这样子,遇到 ZooKeeper session expired , regionserver 将选择 restart 而不是 abort

为了避免 java full GC suspend thread 对Zookeeper heartbeat 的影响,我们还需要对 hbase-env.sh进行配置。

export HBASE_OPTS="$HBASE_OPTS -XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError
-XX:+UseConcMarkSweepGC -XX:+CMSIncrementalMode"

修改成

export HBASE_OPTS="$HBASE_OPTS -XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError
-XX:+UseConcMarkSweepGC -XX:+CMSParallelRemarkEnabled
-XX:+UseCMSInitiatingOccupancyOnly -XX:+UseParNewGC -Xmn256m"
【问题8】如何提高HBase客户端的读写性能?请举例说明。

  ①开启bloomfilter过滤器,开启bloomfilter比没开启要快3、4倍
  ②Hbase对于内存有特别的嗜好,在硬件允许的情况下配足够多的内存给它
  ③通过修改hbase-env.sh中的
export HBASE_HEAPSIZE=3000 #这里默认为1000m
  ④增大RPC数量
通过修改hbase-site.xml中的   
hbase.regionserver.handler.count属性,可以适当的放大。默认值为10有点小
【问题9】断电后regionserver丢失

故障原因
可能是虚拟主机突然断电,hbase的所有节点都在这个虚拟机上,因此全部停机。启动起来后,发现很多region丢失:is not online。

检测HDFS文件是否损坏
使用hadoop命令: hadoop fsck / , 可以看到/ 目录下fs是否是Healthy。

查看-ROOT-、.META.表的状态
通过可视化界面查看-ROOT-、.META.表的状态是否正常。
http://hmaster:60010/master-status

看到只有-ROOT-表,而没有了.META.表,说明meta表损坏,而数据并未丢失。

通过scan ‘.META.’ 确定META表在Region Server2上,而Region Server 2在hbase启动后,过一段时间后,IPC端口就不通了,master无法与region server通讯,无法stop,也无法执行修复命令。
所以需要在hbase服务启动后,在正常状态时,迅速执行修复命令。

zookeeper上存储hbase 基本信息,可以删除后,重新启动,会重新自动创建。
[hbase@hmaster hb]$ hbase-0.94.27/bin/hbase zkcli

[zk: hslave1,hmaster,hslave2:2181(CONNECTED) 1] ls /hbase
[splitlog, online-snapshot, unassigned, root-region-server, table92, backup-masters, rs, table, draining, master, shutdown, hbaseid]

通过查看region信息,发现很多表的region都缺失了。

使用修复meta命令,发现问题依然存在,然后尝试修复assignments,ok。

[hbase@hmaster hb]$ hbase-0.94.27/bin/hbase hbck -fixAssignments

  • 再次确认所有的用户表

通过可视化界面,可以看到所有的表的region信息,之前由于有些表的region信息丢失导致异常,通过http://hmaster:60010/master-status确认所有的表的regions全部恢复。

  • hbase hbck 修复命令
  • 问题分析的主要手段
    1、监控系统:首先用于判断系统各项指标是否正常,明确系统目前状况
    2、服务端日志:查看例如region移动轨迹,发生了什么动作,服务端接受处理了哪些客户端请求。
    3、gc日志:gc情况是否正常
    4、操作系统日志和命令:操作系统层面、硬件是否故障,当前状况如何
    5、btrace:实时跟踪目前服务端的请求和处理情况
    6、运维工具:通过内置于系统中的功能,查看服务器实时处理状况
    其实以上手段,大部分系统都具备,不过各有各的用法,下面我会通过常见的问题来梳理这6大手段。

    常见问题1:个别请求为什么很慢?
    个别请求慢是用户遇到最多的问题,首先需要明确是客户端还是服务端原因,进而分析服务端状况以及捕获这些请求来明确定位。
    1、通过客户端日志来初步分析下慢请求的规律,尝试在客户端确定请求的rowkey和操作类型。
    2、确定是不是一段时间内集中出现慢请求,如果是那么可以参考常见问题2来解决。
    3、查看服务端监控,观察响应时间是否平稳,maxResponseTime是否出现峰值。如果存在,那么可以初步确定是服务端问题。
    4、客户端分析无效,可以通过运维工具在服务端捕获慢请求的rowkey和操作类型。
    5、确定rowkey对应的region,初步查看是否存在数据表参数配置不合理(例如version设置过多、blockcache、bloomfilter类型不正确)、storefile过多、命中率过低等问题。
    6、尝试重试这些请求或者直接分析hfile来查看返回结果是否过大,请求是否耗费资源过多。
    7、查看服务端关于hdfs的监控和日志,以及datanode日志,来分析是否存在hdfs块读取慢或者磁盘故障。

    常见问题2:客户端读写请求为什么大量出错?
    读写请求大量出错的现象主要有两类:1、大量出现服务端exception 2、大量超时。其中第一种有异常信息较好判断问题所在。
    1、大量服务端exception一般是region不在线导致的,可能是region在split但是时间很长超过预期,或是meta数据错误导致客户端获取region location错误。以上现象均可通过日志来定位。
    2、遇到大量超时,首先应该排除服务端是否出现了fullgc或者ygc时间过长。前者可能由于内存碎片、cms gc速度来不及导致,后者一般是由于系统使用了swap内存。
    3、通过系统命令和日志来查看是否有机器load过高,磁盘压力过大,磁盘故障。
    4、查看监控是否出现callqueue积压,请求无法得到及时处理,进一步通过call查看工具或者jstack可以查看正在处理的call和进程堆栈信息。
    5、通过datanode日志和hbase访问dfs的时间,来判断问题是否在hdfs层。
    6、查看监控判断是否出现blocking update,memstore是否已接近系统设置的上限。

    常见问题3:系统为什么越来越慢了?
    系统原来挺快的,为什么越来越慢?多数是不合理的服务端配置导致的,可以通过以下几个方面来分析。
    1、磁盘读写和系统load是不是比以前高了,初步判断导致系统变慢的原因。
    2、如果磁盘读写加剧,重点查看flush是否过小,compact是否过频,尤其是major compact是否有必要,从测试结果来看compact产生的磁盘io对系统性能影响很大。
    3、单个region的storefile个数是否有成倍提高
    4、命中率是否有下降趋势
    5、regionserver是否存在region分配不均衡导致的读写集中,或者读写handler的竞争
    6、datablock的本地化率是否出现下降
    7、是否存在datanode运行不正常,可以通过监控查看是否有个别机器读取block时间明显偏高

    常见问题4:数据为什么没了,明明写进去过?
    数据丢失也是HBase的常见bug,分为临时性和永久性两类。临时性的丢失往往是由于hbase本身的正确性问题导致瞬间读取数据错误。永久性丢失一般是日志恢复bug或者region的二次分配。
    1、首先可以通过hbck或者master日志排查丢失的数据所在region是否发生过二次分配
    2、集群中的regionserver是否出现过abort,日志是否正确恢复。
    3、扫描storefile确定目前数据情况
    4、扫描logs或者oldlogs中的文件来确定是否写入过这些数据,以及写入数据的时间,配合rs的日志来确定当时server的行为
    5、根据写入数据的时间,确定regionserver是否正确完成了flush并且将数据写入磁盘

    常见问题5:为什么有服务器进程挂了?
    regionserver发生abort的场景很多,除了系统bug引起的以外,线上遇到最多的就是fullgc引起的zk节点超时和文件系统异常。
    1、查看regionserver日志查询FATAL异常,确定异常类型
    2、查看gc日志确定是否发生fullgc或者ygc时间过长
    3、如果没有征兆,日志突然中断,首先需要考虑是否发生了OOM(0.94版本会直接kill -9)。
    4、可以通过系统内存监控判断是否出现被占满的情况
    5、查看datanode是否出现异常日志,regionserver可能由于roll log或者flush时的文件系统异常导致abort
    6、排除人为调用stop的情况

    HBase健康体检
    一个集群似乎否健康,大体可以从以下几个方面来判断
    1、单region的storefile数量是否合理
    2、memstore是否得到合理的利用,此项指标与hlog的数量和大小相关
    3、compact和flush的流量比值是否合理,如果每天仅flush 1G却要compact几十上百G就是明显的浪费
    4、split似乎否过频,能否采取pre-sharding的方式来预分配region
    5、集群的region是否过多,zk在默认参数下无法支撑12w以上的region个数,并且region过多也会影响regionserver failover的时间
    6、读写相应时间是否合理,datablock的读取延时是否符合预期
    7、flush队列、callqueue长度、compact队列是否符合预期。前两者的积压都会造成系统不稳定。
    8、failedRequest和maxResponseTime
    9、gc状况,过长的ygc和过频的cms都需要警惕

    运维工具
    HBase官方版本的可运维性的确很差,为了能最大限度的保证线上系统安全,快速定位故障原因,阿里做了很多建设性的工作。
    1、建立了完整的监控体系,根据日常测试和线上运行经验,加入了很多监控点。
    2、监控的粒度达到region级别
    3、call dump和线上慢请求追踪功能
    4、btrace脚本体系,出现问题直接运行查看程序内部信息
    5、日志收集和报警
    6、在线表维护工具和storefile、logs分析工具 

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