统计学习方法 | 第3章 k邻近法

第3章 k近邻法

 

1.$k$近邻法是基本且简单的分类与回归方法。$k$近邻法的基本做法是:对给定的训练实例点和输入实例点,首先确定输入实例点的$k$个最近邻训练实例点,然后利用这$k$个训练实例点的类的多数来预测输入实例点的类。

2.$k$近邻模型对应于基于训练数据集对特征空间的一个划分。$k$近邻法中,当训练集、距离度量、$k$值及分类决策规则确定后,其结果唯一确定。

3.$k$近邻法三要素:距离度量、$k$值的选择和分类决策规则。常用的距离度量是欧氏距离及更一般的pL距离。$k$值小时,$k$近邻模型更复杂;$k$值大时,$k$近邻模型更简单。$k$值的选择反映了对近似误差与估计误差之间的权衡,通常由交叉验证选择最优的$k$

常用的分类决策规则是多数表决,对应于经验风险最小化。

4.$k$近邻法的实现需要考虑如何快速搜索k个最近邻点。kd树是一种便于对k维空间中的数据进行快速检索的数据结构。kd树是二叉树,表示对$k$维空间的一个划分,其每个结点对应于$k$维空间划分中的一个超矩形区域。利用kd树可以省去对大部分数据点的搜索, 从而减少搜索的计算量。

 

距离度量

 

设特征空间$x$$n$维实数向量空间 ,$x_{i}, x_{j} in mathcal{X}$,$x_{i}=left(x_{i}^{(1)}, x_{i}^{(2)}, cdots, x_{i}^{(n)}
ight)^{mathrm{T}}$,$x_{j}=left(x_{j}^{(1)}, x_{j}^{(2)}, cdots, x_{j}^{(n)}
ight)^{mathrm{T}}$ ,则:$x_i$,$x_j$$L_p$距离定义为:

$L_{p}left(x_{i}, x_{j}
ight)=left(sum_{i=1}^{n}left|x_{i}^{(i)}-x_{j}^{(l)}
ight|^{p}
ight)^{frac{1}{p}}$

  • $p= 1$ 曼哈顿距离
  • $p= 2$ 欧氏距离
  • $p= inf$ 闵式距离minkowski_distance
In [1]:
import math
from itertools import combinations
In [2]:
def L(x, y, p=2):
    # x1 = [1, 1], x2 = [5,1]
    if len(x) == len(y) and len(x) > 1:
        sum = 0
        for i in range(len(x)):
            sum += math.pow(abs(x[i] - y[i]), p)
        return math.pow(sum, 1 / p)
    else:
        return 0
 

课本例3.1

In [3]:
x1 = [1, 1]
x2 = [5, 1]
x3 = [4, 4]
In [4]:
# x1, x2
for i in range(1, 5):
    r = {'1-{}'.format(c): L(x1, c, p=i) for c in [x2, x3]}
    print(min(zip(r.values(), r.keys())))
 
(4.0, '1-[5, 1]')
(4.0, '1-[5, 1]')
(3.7797631496846193, '1-[4, 4]')
(3.5676213450081633, '1-[4, 4]')
 

python实现,遍历所有数据点,找出$n$个距离最近的点的分类情况,少数服从多数

In [5]:
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import train_test_split
from collections import Counter
In [6]:
# data
iris = load_iris()
df = pd.DataFrame(iris.data, columns=iris.feature_names)
df['label'] = iris.target
df.columns = ['sepal length', 'sepal width', 'petal length', 'petal width', 'label']
# data = np.array(df.iloc[:100, [0, 1, -1]])
In [7]:
df
Out[7]:
 sepal lengthsepal widthpetal lengthpetal widthlabel
0 5.1 3.5 1.4 0.2 0
1 4.9 3.0 1.4 0.2 0
2 4.7 3.2 1.3 0.2 0
3 4.6 3.1 1.5 0.2 0
4 5.0 3.6 1.4 0.2 0
5 5.4 3.9 1.7 0.4 0
6 4.6 3.4 1.4 0.3 0
7 5.0 3.4 1.5 0.2 0
8 4.4 2.9 1.4 0.2 0
9 4.9 3.1 1.5 0.1 0
10 5.4 3.7 1.5 0.2 0
11 4.8 3.4 1.6 0.2 0
12 4.8 3.0 1.4 0.1 0
13 4.3 3.0 1.1 0.1 0
14 5.8 4.0 1.2 0.2 0
15 5.7 4.4 1.5 0.4 0
16 5.4 3.9 1.3 0.4 0
17 5.1 3.5 1.4 0.3 0
18 5.7 3.8 1.7 0.3 0
19 5.1 3.8 1.5 0.3 0
20 5.4 3.4 1.7 0.2 0
21 5.1 3.7 1.5 0.4 0
22 4.6 3.6 1.0 0.2 0
23 5.1 3.3 1.7 0.5 0
24 4.8 3.4 1.9 0.2 0
25 5.0 3.0 1.6 0.2 0
26 5.0 3.4 1.6 0.4 0
27 5.2 3.5 1.5 0.2 0
28 5.2 3.4 1.4 0.2 0
29 4.7 3.2 1.6 0.2 0
... ... ... ... ... ...
120 6.9 3.2 5.7 2.3 2
121 5.6 2.8 4.9 2.0 2
122 7.7 2.8 6.7 2.0 2
123 6.3 2.7 4.9 1.8 2
124 6.7 3.3 5.7 2.1 2
125 7.2 3.2 6.0 1.8 2
126 6.2 2.8 4.8 1.8 2
127 6.1 3.0 4.9 1.8 2
128 6.4 2.8 5.6 2.1 2
129 7.2 3.0 5.8 1.6 2
130 7.4 2.8 6.1 1.9 2
131 7.9 3.8 6.4 2.0 2
132 6.4 2.8 5.6 2.2 2
133 6.3 2.8 5.1 1.5 2
134 6.1 2.6 5.6 1.4 2
135 7.7 3.0 6.1 2.3 2
136 6.3 3.4 5.6 2.4 2
137 6.4 3.1 5.5 1.8 2
138 6.0 3.0 4.8 1.8 2
139 6.9 3.1 5.4 2.1 2
140 6.7 3.1 5.6 2.4 2
141 6.9 3.1 5.1 2.3 2
142 5.8 2.7 5.1 1.9 2
143 6.8 3.2 5.9 2.3 2
144 6.7 3.3 5.7 2.5 2
145 6.7 3.0 5.2 2.3 2
146 6.3 2.5 5.0 1.9 2
147 6.5 3.0 5.2 2.0 2
148 6.2 3.4 5.4 2.3 2
149 5.9 3.0 5.1 1.8 2

150 rows × 5 columns

In [8]:
plt.scatter(df[:50]['sepal length'], df[:50]['sepal width'], label='0')
plt.scatter(df[50:100]['sepal length'], df[50:100]['sepal width'], label='1')
plt.xlabel('sepal length')
plt.ylabel('sepal width')
plt.legend()
Out[8]:
<matplotlib.legend.Legend at 0x2c56f7f64e0>
 
In [9]:
data = np.array(df.iloc[:100, [0, 1, -1]])
X, y = data[:,:-1], data[:,-1]
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2)
In [10]:
class KNN:
    def __init__(self, X_train, y_train, n_neighbors=3, p=2):
        """
        parameter: n_neighbors 临近点个数
        parameter: p 距离度量
        """
        self.n = n_neighbors
        self.p = p
        self.X_train = X_train
        self.y_train = y_train

    def predict(self, X):
        # 取出n个点
        knn_list = []
        for i in range(self.n):
            dist = np.linalg.norm(X - self.X_train[i], ord=self.p)
            knn_list.append((dist, self.y_train[i]))

        for i in range(self.n, len(self.X_train)):
            max_index = knn_list.index(max(knn_list, key=lambda x: x[0]))
            dist = np.linalg.norm(X - self.X_train[i], ord=self.p)
            if knn_list[max_index][0] > dist:
                knn_list[max_index] = (dist, self.y_train[i])

        # 统计
        knn = [k[-1] for k in knn_list]
        count_pairs = Counter(knn)
#         max_count = sorted(count_pairs, key=lambda x: x)[-1]
        max_count = sorted(count_pairs.items(), key=lambda x: x[1])[-1][0]
        return max_count

    def score(self, X_test, y_test):
        right_count = 0
        n = 10
        for X, y in zip(X_test, y_test):
            label = self.predict(X)
            if label == y:
                right_count += 1
        return right_count / len(X_test)
In [11]:
clf = KNN(X_train, y_train)
In [12]:
clf.score(X_test, y_test)
Out[12]:
0.95
In [13]:
test_point = [6.0, 3.0]
print('Test Point: {}'.format(clf.predict(test_point)))
 
Test Point: 1.0
In [14]:
plt.scatter(df[:50]['sepal length'], df[:50]['sepal width'], label='0')
plt.scatter(df[50:100]['sepal length'], df[50:100]['sepal width'], label='1')
plt.plot(test_point[0], test_point[1], 'bo', label='test_point')
plt.xlabel('sepal length')
plt.ylabel('sepal width')
plt.legend()
Out[14]:
<matplotlib.legend.Legend at 0x2c56f8b0d68>
 
 

scikit-learn实例

In [15]:
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
In [16]:
clf_sk = KNeighborsClassifier()
clf_sk.fit(X_train, y_train)
Out[16]:
KNeighborsClassifier(algorithm='auto', leaf_size=30, metric='minkowski',
           metric_params=None, n_jobs=None, n_neighbors=5, p=2,
           weights='uniform')
In [17]:
clf_sk.score(X_test, y_test)
Out[17]:
0.95
 

sklearn.neighbors.KNeighborsClassifier

  • n_neighbors: 临近点个数
  • p: 距离度量
  • algorithm: 近邻算法,可选{'auto', 'ball_tree', 'kd_tree', 'brute'}
  • weights: 确定近邻的权重
 

kd树

 

kd树是一种对k维空间中的实例点进行存储以便对其进行快速检索的树形数据结构。

kd树是二叉树,表示对$k$维空间的一个划分(partition)。构造kd树相当于不断地用垂直于坐标轴的超平面将$k$维空间切分,构成一系列的k维超矩形区域。kd树的每个结点对应于一个$k$维超矩形区域。

构造kd树的方法如下:

构造根结点,使根结点对应于$k$维空间中包含所有实例点的超矩形区域;通过下面的递归方法,不断地对$k$维空间进行切分,生成子结点。在超矩形区域(结点)上选择一个坐标轴和在此坐标轴上的一个切分点,确定一个超平面,这个超平面通过选定的切分点并垂直于选定的坐标轴,将当前超矩形区域切分为左右两个子区域 (子结点);这时,实例被分到两个子区域。这个过程直到子区域内没有实例时终止(终止时的结点为叶结点)。在此过程中,将实例保存在相应的结点上。

通常,依次选择坐标轴对空间切分,选择训练实例点在选定坐标轴上的中位数 (median)为切分点,这样得到的kd树是平衡的。注意,平衡的kd树搜索时的效率未必是最优的。

 

构造平衡kd树算法

输入:$k$维空间数据集$T={x_1,x_2,…,x_N}$

其中$x_{i}=left(x_{i}^{(1)}, x_{i}^{(2)}, cdots, x_{i}^{(k)}
ight)^{mathrm{T}}$ ,$i=1,2,…,N$

输出:kd树。

(1)开始:构造根结点,根结点对应于包含$T$$k$维空间的超矩形区域。

选择$x^{(1)}$为坐标轴,以T中所有实例的$x^{(1)}$坐标的中位数为切分点,将根结点对应的超矩形区域切分为两个子区域。切分由通过切分点并与坐标轴$x^{(1)}$垂直的超平面实现。

由根结点生成深度为1的左、右子结点:左子结点对应坐标$x^{(1)}$小于切分点的子区域, 右子结点对应于坐标$x^{(1)}$大于切分点的子区域。

将落在切分超平面上的实例点保存在根结点。

(2)重复:对深度为$j$的结点,选择$x^{(1)}$为切分的坐标轴,$l=j(modk)+1$,以该结点的区域中所有实例的$x^{(1)}$坐标的中位数为切分点,将该结点对应的超矩形区域切分为两个子区域。切分由通过切分点并与坐标轴$x^{(1)}$垂直的超平面实现。

由该结点生成深度为$j+1$的左、右子结点:左子结点对应坐标$x^{(1)}$小于切分点的子区域,右子结点对应坐标$x^{(1)}$大于切分点的子区域。

将落在切分超平面上的实例点保存在该结点。

(3)直到两个子区域没有实例存在时停止。从而形成kd树的区域划分。

In [18]:
# kd-tree每个结点中主要包含的数据结构如下
class KdNode(object):
    def __init__(self, dom_elt, split, left, right):
        self.dom_elt = dom_elt  # k维向量节点(k维空间中的一个样本点)
        self.split = split  # 整数(进行分割维度的序号)
        self.left = left  # 该结点分割超平面左子空间构成的kd-tree
        self.right = right  # 该结点分割超平面右子空间构成的kd-tree


class KdTree(object):
    def __init__(self, data):
        k = len(data[0])  # 数据维度

        def CreateNode(split, data_set):  # 按第split维划分数据集exset创建KdNode
            if not data_set:  # 数据集为空
                return None
            # key参数的值为一个函数,此函数只有一个参数且返回一个值用来进行比较
            # operator模块提供的itemgetter函数用于获取对象的哪些维的数据,参数为需要获取的数据在对象中的序号
            #data_set.sort(key=itemgetter(split)) # 按要进行分割的那一维数据排序
            data_set.sort(key=lambda x: x[split])
            split_pos = len(data_set) // 2  # //为Python中的整数除法
            median = data_set[split_pos]  # 中位数分割点
            split_next = (split + 1) % k  # cycle coordinates

            # 递归的创建kd树
            return KdNode(
                median,
                split,
                CreateNode(split_next, data_set[:split_pos]),  # 创建左子树
                CreateNode(split_next, data_set[split_pos + 1:]))  # 创建右子树

        self.root = CreateNode(0, data)  # 从第0维分量开始构建kd树,返回根节点


# KDTree的前序遍历
def preorder(root):
    print(root.dom_elt)
    if root.left:  # 节点不为空
        preorder(root.left)
    if root.right:
        preorder(root.right)
In [19]:
# 对构建好的kd树进行搜索,寻找与目标点最近的样本点:
from math import sqrt
from collections import namedtuple

# 定义一个namedtuple,分别存放最近坐标点、最近距离和访问过的节点数
result = namedtuple("Result_tuple",
                    "nearest_point  nearest_dist  nodes_visited")


def find_nearest(tree, point):
    k = len(point)  # 数据维度

    def travel(kd_node, target, max_dist):
        if kd_node is None:
            return result([0] * k, float("inf"),
                          0)  # python中用float("inf")和float("-inf")表示正负无穷

        nodes_visited = 1

        s = kd_node.split  # 进行分割的维度
        pivot = kd_node.dom_elt  # 进行分割的“轴”

        if target[s] <= pivot[s]:  # 如果目标点第s维小于分割轴的对应值(目标离左子树更近)
            nearer_node = kd_node.left  # 下一个访问节点为左子树根节点
            further_node = kd_node.right  # 同时记录下右子树
        else:  # 目标离右子树更近
            nearer_node = kd_node.right  # 下一个访问节点为右子树根节点
            further_node = kd_node.left

        temp1 = travel(nearer_node, target, max_dist)  # 进行遍历找到包含目标点的区域

        nearest = temp1.nearest_point  # 以此叶结点作为“当前最近点”
        dist = temp1.nearest_dist  # 更新最近距离

        nodes_visited += temp1.nodes_visited

        if dist < max_dist:
            max_dist = dist  # 最近点将在以目标点为球心,max_dist为半径的超球体内

        temp_dist = abs(pivot[s] - target[s])  # 第s维上目标点与分割超平面的距离
        if max_dist < temp_dist:  # 判断超球体是否与超平面相交
            return result(nearest, dist, nodes_visited)  # 不相交则可以直接返回,不用继续判断

        #----------------------------------------------------------------------
        # 计算目标点与分割点的欧氏距离
        temp_dist = sqrt(sum((p1 - p2)**2 for p1, p2 in zip(pivot, target)))

        if temp_dist < dist:  # 如果“更近”
            nearest = pivot  # 更新最近点
            dist = temp_dist  # 更新最近距离
            max_dist = dist  # 更新超球体半径

        # 检查另一个子结点对应的区域是否有更近的点
        temp2 = travel(further_node, target, max_dist)

        nodes_visited += temp2.nodes_visited
        if temp2.nearest_dist < dist:  # 如果另一个子结点内存在更近距离
            nearest = temp2.nearest_point  # 更新最近点
            dist = temp2.nearest_dist  # 更新最近距离

        return result(nearest, dist, nodes_visited)

    return travel(tree.root, point, float("inf"))  # 从根节点开始递归
 

例3.2

In [20]:
data = [[2,3],[5,4],[9,6],[4,7],[8,1],[7,2]]
kd = KdTree(data)
preorder(kd.root)
 
[7, 2]
[5, 4]
[2, 3]
[4, 7]
[9, 6]
[8, 1]
In [21]:
from time import clock
from random import random

# 产生一个k维随机向量,每维分量值在0~1之间
def random_point(k):
    return [random() for _ in range(k)]
 
# 产生n个k维随机向量 
def random_points(k, n):
    return [random_point(k) for _ in range(n)]
In [22]:
ret = find_nearest(kd, [3,4.5])
print (ret)
 
Result_tuple(nearest_point=[2, 3], nearest_dist=1.8027756377319946, nodes_visited=4)
In [23]:
N = 400000
t0 = clock()
kd2 = KdTree(random_points(3, N))            # 构建包含四十万个3维空间样本点的kd树
ret2 = find_nearest(kd2, [0.1,0.5,0.8])      # 四十万个样本点中寻找离目标最近的点
t1 = clock()
print ("time: ",t1-t0, "s")
print (ret2)
 
time:  5.4623788 s
Result_tuple(nearest_point=[0.09929288205798159, 0.4954936771850429, 0.8005722800665575], nearest_dist=0.004597223680778027, nodes_visited=42)
原文地址:https://www.cnblogs.com/shona/p/11320984.html