1.重启不成功是由于/www/wdlinux/mysql-5.5.54/data 中的ib_logfile0、ib_logfile1 和ibdata1的文件存在，可用netstat -lnpt查看当前是否有mysql的进程和端口占用；
2.重启成功后的数据库中有些表不存在，是因为/www/wdlinux/mysql-5.5.54/data 中的ibdata1没有更新，数据还是存在于data中的；
3.mysql配置文件的启动的优先顺序，/etc/my.cnf ...... /www/wdlinux/etc/my.cnf，/etc/my.cnf 中的配置文件会直接影响后续的启动。
以上是个人总结，欢迎指正。