python在fasta文件中寻找motif

import re
matches=re.finditer('(?=ATAT)', 'GATATATGCATATACTT')
for match in matches:
    print((match.start()+1,match.start()+len('ATAT')))

 在匹配模式中?可以查找重叠区域。

###上述的结果为

(2,5)

(4,7)

(10,13)

###假如不用?

输出结果为:

(2,5)

(10,13)

从上述结果可以看出,重叠的区域无法查找出来,我也不晓得为啥????

原文地址:https://www.cnblogs.com/lmt921108/p/8022982.html