教你计算三种分子性质的方法

对于分子的研究会涉及到很多的因素,比如分子的能量和结构、红外和拉曼光谱、振动频率、分子轨道、NMR 屏蔽和磁化系数以及静电势和电子密度等,我们如果通过。Chem 3D软件来计算分子性质就相对来说简单多了。本节ChemDraw使用技巧就来给大家分享一下使用Chem 3D软件计算分子性质的三种方法。

方法1:MM2分子动力学

这一计算分子性质的原理是采用MM2分子动力学方法研究构型在一定温度下构型的转变,操作方法是在Chem 3D绘制窗口画好分子构型之后,单击Calculations菜单或Calculations工具条的MM2命令,即可快速计算该分子构型在不同情况下的数值。

方法2:GAMESS软件包

使用Chem 3D软件的GAMESS软件包可以进行IR、Raman以及NMR光谱的理论模拟和预测。操作方法是单击Calculations菜单并选择GAMESS Interface命令,然后从其子命令中分别选择Predict IR/Paman Spectrum、Predict UV/Vis Spectrum或者Predict NMR Spectrum。正丁烷IR/Raman谱图的AM1计算结果如下图所示:

正丁烷IR/Raman谱图 
正丁烷IR/Raman谱图

温馨提示:使用Chem 3D软件计算分子构性性质之前,需要先进行构型优化。

方法3:分子轨道拓扑图像

绘制分子轨道的拓扑图像也是计算分子性质的方法之一,具体操作方法是在构型优化后,在Chem 3D软件中选择Surfaces菜单下的Choose Surface选项,默认情况下,绘制的是最高占据轨道(HOMO),最低未占据轨道是LUMO,所以需要继续选择Choose Surface的子选项Select Molecular Orbital来选择所要绘制的分子轨道,效果图如下。

Chem 3D软件绘制分子轨道 
Chem 3D软件绘制分子轨道

以上就是使用Chem 3D软件计算三个不同分子构性的方法,熟练掌握后有助于分析分子性质。如果还没有这款化学绘图软件的话,可以点击ChemDraw下载获取。

本文来源于:http://www.chemdraw.com.cn/ruheshiyong/fenzi-xingzhi.html

 

原文地址:https://www.cnblogs.com/MathType/p/5855439.html