interval的排序，合并，取样等功能

内容转自：https://software.broadinstitute.org/gatk/documentation/tooldocs/4.0.1.1/picard_util_IntervalListTools.php
gatk IntervalListTools中合并的picard IntervalListTools的多个操作interval的功能。

1.合并两个interval lists

java -jar picard.jar IntervalListTools 
      ACTION=CONCAT 
      I=input.interval_list 
      I=input_2.interval_list 
      O=new.interval_list

2. 合并两个interval lists，排序并合并重叠区域

java -jar picard.jar IntervalListTools 
       ACTION=CONCAT 
       SORT=true 
       UNIQUE=true 
       I=input.interval_list 
       I=input_2.interval_list 
       O=new.interval_list 

3.从INPUT中提取另外一个INPUT的序列

java -jar picard.jar IntervalListTools 
       ACTION=SUBTRACT 
       I=input.interval_list 
       SI=input_2.interval_list 
       O=new.interval_list 

4.查找input1.interval_list或input2.interval_list，和在input3.interval_list中的碱基：

java -jar picard.jar IntervalListTools 
       ACTION=INTERSECT 
       I=input1.interval_list 
       I=input2.interval_list 
       SI=input3.interval_list 
       O=new.interval_list