Image J是一个基于java的公共的图像处理软件，它是由National Institutes of Health开发的。可运行于Microsoft Windows，Mac OS，Mac OS X，Linux，和Sharp Zaurus PDA等多种平台。其基于java的特点， 使得它编写的程序能以applet等方式分发。
Image J能够显示，编辑，分析，处理，保存，打印8位，16位，32位的图片， 支持TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。Image J支持图像栈（stack）功能，即在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像， 并行处理。只要内存允许，Image J能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作， 比如缩放，旋转， 扭曲， 平滑处理外，Image J还能进行图片的区域和像素统计， 间距，角度计算， 能创建柱状图和剖面图，进行傅里叶变换。
定义
1、百度文库介绍：ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软件，它是由NationalInstitutesofHealth开发的。可运行于MicrosoftWindows，MacOS，MacOSX，Linux，和SharpZaurusPDA等多种平台。其基于java的特点，使得它编写的程序能以applet等方式分发。ImageJ能够显示，编辑，分析，处理，保存，打印8位，16位，32位的图片，支持TIFF,PNG,GIF,JPEG,BMP,DICOM,FITS等多种格式。ImageJ支持图像栈（stack）功能，即在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像，并行处理。只要内存允许，ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作，比如缩放，旋转，扭曲，平滑处理外，ImageJ还能进行图片的区域和像素统计，间距，角度计算，能创建柱状图和剖面图，进行傅里叶变换。
2、科技论文介绍：ImageJ图像分析软件是美国国家心理健康研究所(NationalInstituteofMentalHealth)开发的免费科学图像分析工具，现广泛应用于生物学研究领域。ImageJ软件可计算选定区域内分析对象的一系列几何特征。分析指标包括：长度、角度、周长、面积、长轴、短轴、圆度、最佳椭圆拟合、最小外接矩形拟合以及质心坐标等。此外，ImageJ软件还支持插件技术，用户可根据自身需求用java语言编写各种几何特征分析程序 [1] 。
3、维基百科介绍：是一个基于java的公共的图像处理软件，它是由National Institutes of Health开发的。可运行于Microsoft Windows，Mac OS，Mac OS X，Linux，和Sharp Zaurus PDA等多种平台。其基于java的特点， 使得它编写的程序能以applet等方式分发。
ImageJ能够显示，编辑，分析，处理，保存，打印8位，16位，32位的图片， 支持TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。ImageJ支持图像栈功能，即在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像， 并行处理。只要内存允许，ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作， 比如缩放，旋转， 扭曲， 平滑处理外，ImageJ还能进行图片的区域和像素统计， 间距，角度计算， 能创建柱状图和剖面图，进行傅里叶变换。
ImageJ是一个开放结构的软件， 支持用户自定义插件和宏。ImageJ自带编辑器， 并且导入了java的编译器，实现了简单的IDE功能， 用户可直接基于ImageJ进行图像处理。
ImageJ的源代码提供免费下载
功能
概括一下，主要分为以下几个方面：
1、图像的区域和像素统计（大小），长度，角度。阳性点密度和数量。
2、光密度或辉度，并制备密度直方图和线性图。
3、结构分析如“土壤结构特征”，“表面几何特征 ”等。
3、卷积，Sholl分析，傅里叶分析
4、更多功能
插件
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ImageJ Plugin home
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ImageJ Plugin Project@ Sourceforge.net
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Bio-medical Imaging plugins
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The Image Stabilizer plugin:图像序列去抖动
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OptiNav plugin set：Aeroacoustics, real time histograms, deconvolutions.
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Largeset of pluginsby Gabriel Landini
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Albert Cardona's3D editing plugins。
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Plugins forsurface assessmentfrom GCSCA
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TrakEM2：a plugin for morphological data mining, image annotation and 3D modeling.