步骤如下：右键选中快捷方式属性选项，在快捷方式页，目标一项最后加上-clean选项，如"C:MyEclipse6eclipse.exe" -clean. 然后重新启动一下MyEclipse。让他每次启动都清一下MyEclipse以及其中的项目
这里注意：一定要在引号之外添加，否则会使MyEclipse运行不起来。
我自己使用此方法解决了，如还不行建议重装下MyEclipse。
Myeclipse 错误An internal error has occurred 解决办法
1. 给MyEclipse的快捷方式加个参数再重新启动一次。