本来麦金塔电脑的默认操作系统名为SystemSoftware，至7.5.1正式改名为Mac OS（麦金塔操作系统）。Mac OS至今已经推出了十代。
第十代操作系统名为Mac OS X，至今已经推出五次大型更新。于2009年8月28日发布了Mac OS X 10.6 Snow Leopard。Mac OS X使用Darwin作为系统核心，而Darwin核心是以FreeBSD为范本加以改写而成。苹果官方声称，Mac OS X只能在使用G3或更高阶的微处理器的电脑上运行。但实际上，透过修改，Mac OS X 亦能成功安装并运行在较早期的Power PC 604e上；甚至有人透过PearPC模拟器，在更早期的Centris 650（25MHz）上安装Mac OS X 10.3，只是以此方式安装的Mac OS X，没有多大的实用价值可言。（仅系统自我检测便得花上数天时间）
除了麦金塔操作系统，麦金塔电脑还可以使用以下操作系统：
Mac Logo
1. BeOS
3. Windows（采用Intel CPU的新机种)