WinServer2003 服务器操作系统为例：
一、新建网站：
双击打开 IIS --》在 “网站"上右键--》新建--》网站--》下一步--》描述（随便写）--》下一步--》此网站主机头（此处写网站的域名，例如：http://www.abc.com/ ，其它不用更改）下一步--》输入主目录路径（即找到你网站所在真实目录，将下面允许匿名访问勾选上）--》网站访问权限（如果要运行asp 等脚本程序，则将 “读取”和“运行脚本”这两项勾选）--》下一步--》完成。完成这步操作后，在你刚建好的这个网站上击右键--》属性--》依需要设置各选项，如 asp.net 版本，主目录项下面的 “应用程序池”等。在“目录安全性”项上，编辑“身份验证和访问控制”，一定要启用匿名访问和 “集成 windwos 身份验证”，记住 匿名用户名，例如此机为 “IUSR_WD001”，此帐号即为 “internet 来宾帐号”。过后，要在你网站实际目录上击右键，在 “安全”上，要给此帐号添加进去，允许访问，不然，会出现访问网站时，弹出要求输入登录名和密码的 windwos 验证窗体。
下面是详细说明及设置方法：
Internet 信息服务(IIS)管理器 中
在新建的 网站 名称上击右键，查看 属性，然后，目录安全性，编辑，启用匿名访问，集成windows 身份验证，这两个都要勾选。然后，记住 匿名访问中的用户名，比如是：IUSR_WD001
然后，回到网站实际目录中，在目录上面击右键，属性，然后，安全，添加 IUSR_WD001 用户，然后，赋予权限。此帐号就是 internet来宾帐号。
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此法就可以实现在一台服务器上利用设置不同网站的主机头，实现一台服务器上设置多个虚拟主机的功能。
但前提是这多个虚拟主机的域名要全指向这台服务器的 IP 地址，这样，当不同域名来访问此服务器时，IIS 会根据不同的访问域名，对应你设置 的主机头，来解析你新建的那些网站。
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如果出现以下错误：
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该页无法显示
您试图从目录中执行 CGI、ISAPI 或其他可执行程序，但该目录不允许执行程序。
请尝试以下操作：
- 如果您认为该目录应该允许执行访问权限，请与网站管理员联系。
HTTP 错误 403.1 - 禁止访问：执行访问被拒绝。
Internet 信息服务 (IIS)
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则原因是由于 IIS 中的 “执行权限”选择了 “无” 造成的，应选为 “纯脚本” 就可以了。
二、当你新建的多个网站是要求在不同的 asp.net Framework 下时，则一定要建不同的 “应用程序池”
(你新建的需要运行在不同.netFramework下的的网站，只需指定不同的应用程序池，把这两个网站隔离起来，单独运行就可以了，这样就不冲突了。)
什么是应用程序池呢？这是微软的一个全新概念：应用程序池是将一个或多个应用程序链接到一个或多个工作进程集合的配置。因为应用程序池中的应用程序与其他应用程序被工作进程边界分隔，所以某个应用程序池中的应用程序不会受到其他应用程序池中应用程序所产生的问题的影响。
Windows 2003同时支持两种工作模式，默认为ISS 6.0工作进程隔离模式。工作进程隔离模式防止一个应用程序或站点停止了而影响另一个应用程序或站点，大大增强了IIS的可靠性。那么如何设置两种工作
启动IIS管理器，右击网站，选择“属性”，打开属性对话框。在IIS 6.0工作进程隔离模式下，所有的应用程序代码都在隔离环境中运行，它们是如何进行隔离的呢？Windows 2003新增了应用程序池，工作进程隔离模式允许客户创建多个应用程序池，每个应用程序池都可以有不同的配置。因为这些应用程序池直接从内核（而非WWW服务）接收它们的请求，所以性能和可靠性得到了增强。要隔离运行在同一台计算机上但属于不同网站的Web应用程序，需要为每个网站创建单独的应用程序池。
创建应用程序池
在IIS管理器中，打开本地计算机，右键单击“应用程序池”，选择新建“应用程序池” （必须在工作进程隔离模式下才能建立应用程序池） 。“应用程序池名称”框中，输入新的应用程序池名称。如果在“应用程序池 ID”框中出现的 ID （如：AppPool #1）不是您想要的，可进行重命名。如果您单击了“将现有应用程序池作为模板”，请在“应用程序池名称”框中右键单击想要用来作为模板的应用程序池。最后单击[确定]。
指派应用程序池
在 IIS 管理器中，右键单击您要为其指派应用程序池的应用程序，然后单击“属性”。 单击“主目录”选项卡，确认您正在指派的目录或虚拟目录的“应用程序名”是否已被填写。如果“应用程序名”框尚未被填写，请单击“创建”，然后输入名称。
在“应用程序池”列表框中，选择您想要为其指派的应用程序池的名称。最后单击[确定]。