第一种:
在使用主题的时候出现 控件包含代码块(即 <% ... %>)，因此无法修改控件集合错误,原来错误的原因是:
控件包含代码块(即 <% ... %>)，因此无法修改控件集合。 将这些代码去掉，相应的功能在代码中实现即可。
<%=.....%>
造成这个错误的原因是：在<head runat="server"></head>里面，使用了类似这样的代码,
把Head中使用的<%=.....%>的脚本放到body中,就OK了.
Source:http://www.cnblogs.com/mczhu/archive/2008/08/20/1272063.html
发现了自己的Main.Master中有：
<title>**管理系统</title>
<script src="<%=GetServerUri()%>Scripts/main.js" type="text/javascript" language="javascript"></script>
第二种:
<asp:Content ID="Content1" ContentPlaceHolderID="ContentPlaceHolder" runat="server">
<script language="javascript" type="text/javascript">
function Button1_onclick() {
var msg = document.getElementById('<%= this.lblMessage.ClientID %>'); // 就是这里错误 ，lblMessage 服务器端控件
alert(msg.value);
}
</script>
“/”应用程序中的服务器错误。
控件包含代码块(即 <% ... %>)，因此无法修改控件集合。
说明:
执行当前 Web 请求期间，出现未处理的异常。请检查堆栈跟踪信息，以了解有关该错误以及代码中导致错误的出处的详细信息。
异常详细信息: System.Web.HttpException: 控件包含代码块(即 <% ... %>)，因此无法修改控件集合。
在做项目偶尔遇见了这个小问题。反复查看脚本是否错误。最后做了个简单例子，还是不可以，（我的是有master模板页面的，而javascript是在其他page页面）。开始在网上找。
大多数的解决放法
1，把Head标签中的Runat=“server” 去掉，我试了又试还是不好用，
2，说吧javascript脚本放到body中，
javascript写到了page页面重，所有，上述方法没有解决我出现的问题，
想了想以前的项目曾经用过，翻出来看吧。哦。原来是在用户控件中，结果试一下。果真没有问题了。
查看了一下错误信息及源码，哦。原来问题是出现在我的javascript脚本放在用户控件的时候在相当与放在 一个带有runat="server" 的代码框中，
<div runat="server" id="div1">
<script language="javascript" type="text/javascript">
function Button1_onclick() {
var msg = document.getElementById('<%= this.lblContent.ClientID %>'); // 就是这里错误 ，lblContent服务器端控件
alert(msg.value);
}
</script>
</div>
一定要 在div中添加 runat="server" 当然你也可以用panel ，都可以解决问题
果然。错误消失了
补充一下：在我的界面中应用了ajax框架。我没有测试是不是这的原因。
具体这个解决办法可能不是太好，有好办法大家一起来讨论一下。