应该说
窗口坐标 是相对于 视口坐标 而言
逻辑坐标 是相对于 设备坐标 而言
补充：
窗口坐标是基于逻辑坐标的.
视口坐标是基于设备坐标.
上面这两话是抄自百度百科的，我的理解是：
窗
口坐标的单位长度与逻辑坐标的单位长度相同,也就是说，当你在窗口坐标上画图时，传递给画图函数的参数的单位是逻辑单位。但是当windows把图形输出
到屏幕上时，并不是直接把图形按照它在窗口坐标上的位置输出到屏幕上的，而是先把它在窗口坐标上的值转换成视口坐标上的值（与此同时，也把逻辑坐标按照不
同的映射模式转换成设备坐标）。下面举例说明：
由于
一般情况下，窗口原点是与视口原点相同的，（也就是说，位于屏幕上的同一个位置），为了体会不窗口坐标与视口坐标的转换，先用
SetwindowtOrg(100,-300)将视口移到(100,-300)，这相当于把 逻辑点(100,-300)映射到设备点（0,0）
（注意：如果改用SetviewportOrg移动原点，则其原点的移动尺寸与映射模式无关，其300个长度单位等于9厘米）
(注：这个设备点也是相对于当前的DC而言，如果当前的DC是整个屏幕，那么设备点（100，-300）的原点就在屏幕的左上角，如果当前的DC是某个应用程序的客户区，那么设备点（100，-300）的原点就是应用程序的客户区的左上角，)
现在假设当前DC是某个应用程序的客户区，映射模式为 MM_LOMETRIC
(在这种映射模式下，设备坐标以0.1 毫米为一个长度单位,Y轴的正方向为向上，也就是说，屏幕上的左上角的Y坐标为0,下面的Y坐标均小于0),当使用语句：
MoveTo(100,-600);
LineTo(100,-800);//Y轴负方向向下，所以用负值
进行画图时，它的转换过程如下：
1)窗口与视口坐标转换，由于窗口坐标（100,-300 ),映射为设备坐标（0,0）,所 以
窗口(100,-600)映射为视口(0,-300)
窗口(100,-800)视映射为视口(0,-500)
2)逻辑与设备坐标转换
由于是 MM_LOMETRIC 映射模式，设备坐标的单位长度为 0.1mm，而在输出时用的是视口坐标，所以视口坐标（100，-600）输出到屏幕上时，该点的位置
距客户区左边 0 厘米，距客户区上边 3厘米。这就是直线的起点；
再把直线终点的视口坐标(100，-800）输出到距客户区左边0厘米，距客户区上边 5厘米处。
以上就是全部过程
在不同的映射模式下，一个逻辑单位 对应 不同的 设备单位，
例如：在 MM_TEXT 映射模式下，设备坐标是以像素为单位的，
也就是说，如果你这时要用一个函数画一条直线，并且传递给它的参数大小为
100，（通常情况下，传递给函数的参数通常是视作逻辑坐标下的数值，也就是说，这里的100指的是逻辑坐标里100个单位长度.不过也不一定，用时请看具体情况，这个我也不大清楚），那么它将会在屏幕上画一条100像素长的线条，
如果是在 MM_LOMETRIC 映射模式下，设备坐标是以0.1 毫米为一个长度单位的，如果你这时要用一个函数画一条直线，并且传递给它的参数大小为
100，那么它将会在屏幕上画出 0.1毫米 * 100 = 10 厘米 长的直线，
当然，由于各种复杂的原因，画长的直线可能并不是刚好10 厘米长，但误差不会很大
至于窗口与视口坐标的问题，你可以看这里
http://baike.baidu.com/view/1522985.htm
补充：
我的理解是这样的，窗口坐标与视口坐标是与DC（即设备上下文）相关的，如果
DC是整个屏幕，那么窗口坐标的原点就是屏幕的左上角，如果DC是一个应用程序的窗口的客户区，那么窗口坐标的原点就是该客户区的左上角