1、IGV的网址：http://software.broadinstitute.org/software/igv/（java环境）
常见的几种输入格式bam/sam(比对文件) TDF(bam的精简版) bed（注释文件） gtf/gff（注释文件）
PSL(blat比对结果) VCF(snp,indel的信息) WIG（UCSC数据库推荐格式wiggle track format） IGV（IGV默认的格式）
2、操作指南：http://www.docin.com/p-1847147664.html
1、导入参考基因组： genomes >> load genome from file >> reference.fasta
2、导入注释文件： file >> load from file >> reference.gtf #文件要按坐标排序，已经排过
3、bam格式转TDF格式： rools >> runigvtools >> count >> sampleA.bam >> run ,再生成另外一个sampleB.bam文件的TDF
bam文件必须和参考基因组文件同一目录下，否则失败
4、导入TDF文件： file >> load from file >>sampleA.bam.tdf ；file >> load from file >>sampleB.bam.tdf
5、导入甲基化文件（IGV格式）：file >> load from file >> sampleA.igv ;file >> load from file >> sampleB.igv