首先下载升级所需文件，共计两个zip包：
esxupdate 公告，pre-upgrade-from-ESX4.0-to-4.1.0-0.0.内部版本号-release.zip
升级公告，upgrade-from-ESX4.0-to-4.1.0-0.0.内部版本号-release.zip
第一步：关闭主机上所有的虚拟机，并将主机置于维护模式。
第二步：通过服务控制台或SSH以root登录esx4.0主机，执行如下命令：esxcfg-firewall --allowIncoming –allowOutgoing
第三步：通过在 vSphere CLI 计算机上运行以下命令安装升级包，命令格式举例如下：
vihostupdate.pl -i –server ip地址 --username root --password 密码 -b D:\pre-upgrade-from-esx4.0-to-4.1-update01-348481.zip
vihostupdate.pl -i --server ip地址 --username root --password 密码 -b D:\upgrade-from-esx4.0-to-4.1-update01-348481.zip
第三步：以上执行完毕后，重启主机。
第四步：恢复第二步的操作，防火墙重置为高安全性：esxcfg-firewall –blockOutgoing
第五步：通过vSphere Client 4.1（安装简单不再多说）登录主机，将主机退出维护模式，恢复虚拟机，至此主机升级完毕。
第六步：安装vCenter4.1，需要一台64位CPU和操作系统的机器才能安装vCenter4.1，安装完成后，再将主机添加到里面。
注意：本人在第五步操作时通过vCenter4.0试图连接升级后的ESX4.1主机，出现连接无响应等错误，后发现必须使用vCenter4.1才能管理ESX4.1主机，由于vCenter升级需要x64系统，如果你暂时没有64位环境的话，可以先直接登录ESX4.1主机（第五步）恢复虚拟机的运行，然后再进行vCenter的升级。