Cache占用过多内存导致Linux系统内存不足问题排查

问题描述

Linux服务器内存使用量超过阈值,触发报警。

问题排查

首先,通过free命令观察系统的内存使用情况,显示如下:

total       used       free     shared    buffers     cached 
Mem:      24675796   24587144      88652          0     357012    1612488 
-/+ buffers/cache:   22617644    2058152 
Swap:      2096472     108224    1988248 

其中,可以看出内存总量为24675796KB,已使用22617644KB,只剩余2058152KB。

然后,接着通过top命令,shift + M按内存排序后,观察系统中使用内存最大的进程情况,发现只占用了18GB内存,其他进程均很小,可忽略。

因此,还有将近4GB内存22617644KB-18GB,约4GB)用到什么地方了呢?

进一步,通过cat /proc/meminfo发现,其中有将近4GB3688732 KB)的Slab内存:

...... 
Mapped:          25212 kB 
Slab:          3688732 kB 
PageTables:      43524 kB 
...... 

Slab是用于存放内核数据结构缓存,再通过slabtop命令查看这部分内存的使用情况:

OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME 
13926348 13926348 100%    0.21K 773686       18   3494744K dentry_cache 
334040 262056  78%    0.09K   8351       40     33404K buffer_head 
151040 150537  99%    0.74K  30208        5    120832K ext3_inode_cache 

发现其中大部分大约3.5GB)都是用于了dentry_cache。

问题解决

1. 修改/proc/sys/vm/drop_caches,释放Slab占用的cache内存空间参考drop_caches的官方文档):

Writing to this will cause the kernel to drop clean caches, dentries and inodes from memory, causing that memory to become free. 
To free pagecache: 
* echo 1 > /proc/sys/vm/drop_caches 
To free dentries and inodes: 
* echo 2 > /proc/sys/vm/drop_caches 
To free pagecache, dentries and inodes: 
* echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches 
As this is a non-destructive operation, and dirty objects are notfreeable, the user should run "sync" first in order to make sure allcached objects are freed. 
This tunable was added in 2.6.16. 

2. 方法1需要用户具有root权限,如果不是root,但有sudo权限,可以通过sysctl命令进行设置:

$sync 
$sudo sysctl -w vm.drop_caches=3 
$sudo sysctl -w vm.drop_caches=0 #recovery drop_caches 

操作后可以通过sudo sysctl -a | grep drop_caches查看是否生效。

3. 修改/proc/sys/vm/vfs_cache_pressure,调整清理inode/dentry caches的优先级默认为100),LinuxInsight中有相关的解释:

At the default value of vfs_cache_pressure = 100 the kernel will attempt to reclaim dentries and inodes at a “fair” rate with respect to pagecache and swapcache reclaim. Decreasing vfs_cache_pressure causes the kernel to prefer to retain dentry and inode caches. Increasing vfs_cache_pressure beyond 100 causes the kernel to prefer to reclaim dentries and inodes.
具体的设置方法,可以参考方法1或者方法2均可。

参考资料

https://www.kernel.org/doc/Documentation/sysctl/vm.txt
http://major.io/2008/12/03/reducing-inode-and-dentry-caches-to-keep-oom-killer-at-bay/
http://linux-mm.org/Drop_Caches
以下记录的是进一步排查的进展情况。

更深层次的原因

上文排查到Linux系统中有大量的dentry_cache占用内存,为什么会有如此多的dentry_cache呢?

  1. 首先,弄清楚dentry_cache的概念及作用:目录项高速缓存,是Linux为了提高目录项对象的处理效率而设计的;它记录了目录项到inode的映射关系。因此,当应用程序发起stat系统调用时,就会创建对应的dentry_cache项更进一步,如果每次stat的文件都是不存在的文件,那么总是会有大量新的dentry_cache项被创建)。

  2. 当前服务器是storm集群的节点,首先想到了storm相关的工作进程,strace一下storm的worker进程发现其中有非常频繁的stat系统调用发生,而且stat的文件总是新的文件名:

sudo strace -fp -e trace=stat
3. 进一步观察到storm的worker进程会在本地目录下频繁的创建、打开、关闭、删除心跳文件,每秒钟一个新的文件名:

sudo strace -fp -e trace=open,stat,close,unlink
以上就是系统中为何有如此多的dentry_cache的原因所在。

一个奇怪的现象

通过观察/proc/meminfo发现,slab内存分为两部分:

SReclaimable // 可回收的slab
SUnreclaim // 不可回收的slab

当时服务器的现状是:slab部分占用的内存,大部分显示的都是SReclaimable,也就是说可以被回收的。

但是通过slabtop观察到slab内存中最主要的部分dentry_cache)的OBJS几乎都是ACTIVE的,显示100%处于被使用状态。

OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME                   
13926348 13926348 100%    0.21K 773686       18   3494744K dentry_cache
334040 262056  78%    0.09K   8351       40     33404K buffer_head
151040 150537  99%    0.74K  30208        5    120832K ext3_inode_cache

为什么显示可回收的,但是又处于ACTIVE状态呢?求Linux内核达人看到后热心解释下:

会不会由于是ACTIVE状态,导致dcache没有被自动回收释放掉呢?

让系统自动回收dcache

上一小节,我们已经提到,服务器上大部分的slab内存是SReclaimable可回收状态的,那么,我们能不能交给操作系统让他在某个时机自动触发回收操作呢?答案是肯定的。

查了一些关于Linux dcache的相关资料,发现操作系统会在到了内存临界阈值后,触发kswapd内核进程工作才进行释放,这个阈值的计算方法如下:

1. 首先,grep low /proc/zoneinfo,得到如下结果:
        low      1
        low      380
        low      12067
2. 将以上3列加起来,乘以4KB,就是这个阈值,通过这个方法计算后发现当前服务器的回收阈值只有48MB,因此很难看到这一现象,实际中可能等不到回收,操作系统就会hang住没响应了。
3. 可以通过以下方法调大这个阈值:将vm.extra_free_kbytes设置为vm.min_free_kbytes和一样大,则/proc/zoneinfo中对应的low阈值就会增大一倍,同时high阈值也会随之增长,以此类推。
$ sudo sysctl -a | grep free_kbytes       
vm.min_free_kbytes = 39847
vm.extra_free_kbytes = 0
$ sudo sysctl -w vm.extra_free_kbytes=836787  ######1GB
4. 举个例子,当low阈值被设置为1GB的时候,当系统free的内存小于1GB时,观察到kswapd进程开始工作进程状态从Sleeping变为Running),同时dcache开始被系统回收,直到系统free的内存介于low阈值和high阈值之间,停止回收。

http://www.cnblogs.com/panfeng412/p/drop-caches-under-linux-system-2.html

原文地址:https://www.cnblogs.com/muahao/p/6531772.html