redhat之数据挖掘R语言软件及rstudio-server服务的安装

安装时间：2015年8月25日 22：55：35
作者：luomg
软件：R、Rstudio-server
环境：redhat6.2
联系：luomgf@163.com
声明：如果你有遇到安装中的问题欢迎跟帖交流

今日倒腾了一下午终于搞定了R环境的安装，R由于调用了很多fortran库，安装略显麻烦，提供安装脚本之前先来个hell word

*如下为安装脚本，可以直接复制执行，也可以写成脚本

 1 yum install  *fortran*  texinfo g++    glibc*  gcc-c++     readline*   libXt-devel   java*    -y  
 2 #wget http://ftp.iitm.ac.in/cran/src/base/R-3/R-3.2.2.tar.gz    
 8 
 9 curl  -O  http://ftp.iitm.ac.in/cran/src/base/R-3/R-3.2.2.tar.gz   
10 tar  -zxf  R-3.2.2.tar.gz 
11 cd R-3.2.2
12 ./configure  --enable-R-shlib   --enable-R-static-lib --enable-BLAS-shlib    --enable-static=yes  --enable-shared=yes
13 make CFLAGS=-fPIC
14 make install
15 cp lib/libR*  /usr/local/lib64/R/lib/
16 
17 curl   -O https://download2.rstudio.org/rstudio-server-rhel-0.99.484-x86_64.rpm
18 rpm  -ivh  rstudio-server-rhel-0.99.484-x86_64.rpm
19 rstudio-server verify-installation
20 iptables  -A INPUT -p tcp -dport 8787 -j ACCEPT
21 netstat   -antl

安装常见问题

1、无法安装pdf

/usr/bin/install: 无法获取"NEWS.pdf" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
/usr/bin/install: 无法获取"NEWS.pdf" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
make: *** [install-sources2] 错误 1

解决办法：这个问题是由于服务器最小化安装导致不能整上pdf的doc帮助，所以去掉即可

vim doc/Makefile

将18、19行改为下面这样，即去掉NEWS.pdf

INSTFILES2 = NEWS.rds NEWS
NON_SVN_INSTFILES = FAQ RESOURCES NEWS

INSTFILES2 = NEWS.rds NEWS
19 #NEWS.pdf
20 NON_SVN_INSTFILES = FAQ RESOURCES NEWS
21 #NEWS.pdf
22 ## generated later.

【更新】

2015年9月15日 13:18:42 rstudio-server执行plot函数报错

> plot(data$VALUE)
Error in RStudioGD() : 
  Shadow graphics device error: r error 4 (R code execution error)
此外: Warning message:
In grDevices:::png("/tmp/RtmpcMXZp5/661bb3eb614046e699ef8e2416bbf4b8.png",  :
  本R版本不支持png

　　解答：执行函数capabilities()观察支持情况

2015年9月12日 23:57:10 如果发现verify没有问题，但是还是访问不了，这个时候需要查看防火墙设置
2015年9月11日 17:39:51 更新下载命令，将代码作为bash插入，方便复制
2015年9月11日 16:18:45 更新安装基础文件
2015年8月25日 23:28:33 增加对安装pdf失败的补充