R语言多元分析系列之五:聚类分析(完) | R blogs / lang

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二、K均值聚类
K均值聚类又称为动态聚类,它的计算方法较为简单,也不需要输入距离矩阵。首先要指定聚类的分类个数N,随机取N个样本作为初始类的中心,计算各样本与类中心的距离并进行归类,所有样本划分完成后重新计算类中心,重复这个过程直到类中心不再变化。

在R中使用kmeans函数进行K均值聚类,centers参数用来设置分类个数,nstart参数用来设置取随机初始中心的次数,其默认值为1,但取较多的次数可以改善聚类效果。model2$cluster可以用来提取每个样本所属的类别。
model2=kmeans(data,centers=3,nstart=10)
使用K均值聚类时需要注意,只有在类的平均值被定义的情况下才能使用,还要求事先给出分类个数。一种方法是先用层次聚类以决定个数,再用K均值聚类加以改进。或者以轮廓系数来判断分类个数。改善聚类的方法还包括对原始数据进行变换,如对数据进行降维后再实施聚类。

cluster扩展包中也有许多函数可用于聚类分析,如agnes函数可用于凝聚层次聚类,diana可用于划分层次聚类,pam可用于K均值聚类,fanny用于模糊聚类。
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