Linux 命令速查

学生信,Linux是最最基本的技能,要尽量将自己的工作平台转移到Linux,编程写脚本,这样会极大的提升工作效率,找工作时也不会太怂。Linux所有的任务都是通过命令来完成的,具有高度的统一性。Linux命令多,不可能都会,根据具体需求掌握部分即可。

索引


目录文件管理:pwd/tree/ls/cd/touch/mv/rm/unlink/cp/mkdir/rmdir/

文本操作:less/cat/more/head/tail/ – vi/nano/sed/emacs/ – cut/paste/join/sort/uniq/diff/cmp/nl

文件分隔合并:grep/split/printf/wc/uniq/paste/sort/join

查找:find/grep/wc – which/whereis/locate/

传输:wget/ssh/scp/curl/ftp/lftp/mysql/

系统:top/ps/kill/df/free/qsub/qdel/qstat

权限:chmod/chown/chgrp/file/stat

打包压缩解压:tar/gzip/bzip2

其他:ln/ssh/alias/date/cal/sleep/clear/who/whatis/man/echo/history/nohup/xargs

awk

重定向

管道

多种方法连接Linux(Xshell、putty、VNC)和Windows

shell脚本

PATH环境变量设置

软件安装

软件版本管理,编程环境管理,模块管理


vi配置

几乎所有的程序和脚本都是在vi下编写的,因此配置好vi将会大大的提高编程效率,也可以看出一个程序员的专业性。

首先就是要显示行号,便于调试时错误定位,临时的在vi下输入:nu;或将set nu写入本地vi配置文件;root用户可以修改/etc/vim/配置

vi ~/.vimrc
> set nu

我选择了github上热门的配置:The Ultimate vimrc

vi常用命令

awk

qstat -u zxli | awk '{if($10=="Q") print $1}' | xargs qdel
awk '{arr[$1]}END{for(key in arr){print key}}' > $read_names

sort和uniq

sort -u和uniq都可以去重,但应用的情况不同,其实sort -u等价于sort | uniq。

uniq只能对连续的重复归一,sort -u就是排序后归一去重。

参考:生信分析人员如何系统入门linux?

原文地址:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5760193.html