虽然MAF实现了插件式开发，动态热插拨，AppDomain隔离等诸多优点，但是正因为它复杂的功能机制也带来了很多其它方面的使用限制，下面列出官方给出的MAF框架的使用限制。
1) 在应用主程序显示的插件UI不遵循主程序的剪切行为。
2) 在可交互场景空间的概念同样也适用于插件。
3) 一些应用主程序的的服务，比如资源继承，数据绑定，命令等对插件UI来说不是自动实现的，如果要使用这些服务需要更新这个pipeline。
4) 一个插件UI不能被旋转，伸缩，倾斜，否则会被一个变形动作影响。
5) 应用主程序里面的插件不透明度只能设置为100%。
6) 当应用主程序窗体的“AllowsTransparency”设置为true，窗体里面的插件将不会显示。
7) 在一个窗体中，插件的UI永远在保持在其它WPF元素的最顶层。
8) 插件的UI不能被VisualBrush渲染。
9) 媒体文件不能被插件UI中的MediaElement播放。
10) 应用主程序既不会接收也不会触发插件UI生成的鼠标事件，主应用程序UI的“IsMouseOver ”属性值总是为false。
11) 当焦点转移到插件UI的控件中时，主应用程序的GotFocus和LostFocus的事件既不能接收也不能触发。
12) 当打印的时候主应用程序含有插件的部分显示白色。
13) 当主程序继续运行，插件要被卸载之前必须先手动关闭插件的调试程序。
14) 当插件UI为InkCanvas或包含一个InkCanvas时，不能卸载该插件。
15) 当创建多个应用程序域时，创建和启动的时间可能会影响程序的性能。
英文水平有限，如不太明白的可以直接查看官网描述：https://msdn.microsoft.com/en-us/library/bb909794.aspx