发卡构型高分子的跨膜传输

接枝在平面上的高分子链的自由能

考虑一平面附近的高分子链,链长为(N),库恩长度为(b),高分子链两端点分别位于(z_i)(z_f)处,则高分子链传播子为

egin{equation*} G(z_i,z_f,N)=sqrt{frac{3}{2pi Nb^2}}left (expleft [-frac{3(z_f-z_i)^2}{2Nb^2} ight ] - expleft [-frac{3(z_f+z_i)^2}{2Nb^2} ight ] ight ) end{equation*}

此高分子一端被固定在平面附近(z_i=Delta ightarrow 0),则高分子链配分函数为

egin{equation*} mathcal Z sim int_0^infty G(Delta,z,N)mathrm dz=mathrm {erf}left (sqrt{frac{3}{2Nb^2}}Delta ight ) end{equation*}

又,(Delta ightarrow 0)(N gg 1),于是,

egin{equation*} mathcal Z_{mathrm {ln}} sim N^{-1/2} end{equation*}

对于该高分子链是环形高分子链,(z_f=z_i=Delta),则配分函数为

egin{equation*} mathcal Z_{mathrm {lp}} sim sqrt{frac{3}{2pi Nb^2}}left (1- expleft [-frac{3(2Delta)^2}{2Nb^2} ight ] ight ) sim N^{-1.5} end{equation*}

接枝在一平面上的线形链自由能为

egin{equation*} frac{F_{mathrm {ln}}}{k_BT}=-lnmathcal Z_{mathrm {ln}}=frac{1}{2}ln N+const. end{equation*}

接枝在一平面上的环形链自由能为

egin{equation*} frac{F_{mathrm {lp}}}{k_BT}=-lnmathcal Z_{mathrm {lp}}=frac{3}{2}ln N+const. end{equation*}

高分子跨膜传输熵垒

首先看环形链跨膜传输。设链长为(N),已传输的链节数为(m)


环形链跨膜传输

自由能为

egin{equation*} frac{F_{mathrm {lp}}(m)}{k_BT}=frac{3}{2}ln m(N-m)+mDelta mu end{equation*}

上式已略去有关常数项,(Delta mu)为膜两边的化学势梯度。

下面看线性链的传输,如下图所示,链长为(N),当已经有(m)链节传输到膜另一边,尚有(N-m)链节尚未传输,膜两边可分别看做两条接枝到平面上的高分子链。则自由能为

egin{equation*} frac{F_{mathrm {ln}}(m)}{k_BT}=frac{1}{2}ln m(N-m)+mDelta mu end{equation*}


线性链跨膜传输

对于线性链传输,高分子链有可能出现发卡(hairpin)构型,如下面两图所示,


发卡构型的高分子跨膜传输。发卡出现在左边。


发卡构型的高分子跨膜传输。发卡出现在右边。

下面讨论一下发卡构型中两只尾巴的自由能。各种链长的尾巴出现的概率是不一样的,设两只尾巴的链长分别为(p)(n-p),尾巴的配分函数为

egin{equation*} Psim int_0^n exp left [-frac{1}{2}ln p(n-p) ight ]=pi end{equation*}

各种尾巴出现的概率都相等,与链长无关。(好奇怪!是不是搞错了?

考虑到各种可能的情况,线性链传输自由能为

egin{equation*} frac{F_{mathrm {ln}}(m)}{k_BT}=-lnleft [ (m(N-m))^{-1/2}+pi m^{-3/2}+pi (N-m)^{-3/2} ight ]+mDelta mu end{equation*}

方括号里第一项为膜两边都是线性链的情况,第二项为右边为环形链,左边为两个尾巴的情况,第三项为左边为环形链,右边为两个尾巴的情况。

有了自由能就可以计算传输时间了。

原文地址:https://www.cnblogs.com/joyfulphysics/p/5669031.html