1. 有参与无参转录组分析
2. lncRNA分析
以RNA-Seq测序技术为基础的转录组测序作为高通量测序时代核心技术之一，已在生物科学及医学领域前沿研究中获得广泛应用。RNA-Seq可进行全基因组水平的基因表达差异研究，具有定量更准确、可重复性更高、检测范围更广、分析更可靠等特点，真核生物的基因表达调控，癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定，遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。长链非编码RNA(LncRNAs)是一类长度超过200nt的非编码RNA分子，其表达水平相对于蛋白编码基因较低，但它们在Ｘ染色体沉默、基因组印迹、染色体修饰、转录激活、转录干扰以及核内运输等方面具有重要的功能，广泛参与细胞周期调控、生长发育、胚胎干细胞分化等多种生物学过程。近些年lncRNA的研究进展迅猛，许多动植物以及人类疾病的相关研究课题都离不开lncRNA的影子，其中基于NGS的的转录组分析技术在lncRNA的信息挖掘中起到了非常重要的作用。