BeyondCompare支持不同的版本控制系统相关工具，官网说明: http://www.scootersoftware.com/support.php?zz=kb_vcs。本文仅针对比较常用的TortoiseSVN/TortoiseGit进行说明
TortoiseSVN
在资源管理器右键菜单中：TortoiseSVN-Settings
-
设置比较不同版本文件的程序，选择External(外部)，在下面文本框中填入如下内容，其中前半部分是BComp.exe所在目录：
"C:Program FilesBeyond Compare 4BComp.exe" %base %mine /title1=%bname /title2=%yname /leftreadonly -
设置读取GNU patch files的程序，选择External(外部)，在下面文本框中填入BCompare.exe所在目录：
C:Program FilesBeyond Compare 4BCompare.exe
- 设置解决文件冲突的程序,选择External(外部)，在下面文本框中填入如下内容，其中前半部分是BComp.exe所在目录：
"C:Program FilesBeyond Compare 4BComp.exe" %mine %theirs %base %merged /title1=%yname /title2=%tname /title3=%bname /title4=%mname
操作完成后点击确定结束。
TortoiseGit
在资源管理器右键菜单中：TortoiseGit-Settings，后续操作步骤和TortoiseSVN相同:
