R语言学习笔记（五）绘图(1)

  R是一个惊艳的图形构建平台，这也是R语言的强大之处。本文将分享R语言简单的绘图命令。

  本文所使用的数据或者来自R语言自带的数据(mtcars)或者自行创建。

  首先，让我们来看一个简单例子：

dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
plot(dose, drugA)

绘制的图形如下：

   我们有必要对上述代码做些说明：首句和第二条语句创建两个向量，第三条语句打开一个图形窗口并生成一幅散点图。
  这也许是个极为简单的例子，因为并没有涉及到太多其他关于图形参数(如符号与线条，颜色，文本属性，图形尺寸和边界大小等)方面的知识。接下来，我们将在此基础上讲讲图形参数的设置。

1.1 符号与线条

if(FALSE){该例展示如何利用par函数修改图形参数}
dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
if(FALSE){no.readonly=TRUE可以生成一个可以修改的当前图形参数列表}
opar <- par(no.readonly = TRUE)
if(FALSE){虚线+实三角}
par(lty=2, pch=17)
if(FALSE){b表示绘制点和线}
plot(dose, drugA, type="b")
par(opar)

绘制的图形如下：

 上述代码中的图形参数设置也可以通过键值对来实现，并不需要par()函数，如下：
```R dose <- c(20, 30, 40, 45, 60) drugA <- c(16,20,27,40,60) plot(dose, drugA, type="b",lty=2,pch=17) ```   可以设置的符号和线条的参数有：

• pch:绘制点时使用的符号（范围：0~25）；
• cex:绘制符号的大小（默认值为1）；
• lty:线条类型（范围1~6）；
• lwd:线条宽度（默认值为1）；

1.2 颜色

  R语言图形的颜色参数常用如下：

• col:默认绘图颜色；
• col.axis:坐标轴刻度文字的颜色；
• col.lab:坐标轴标签的颜色；
• col.main:标题的颜色；
• col.sub:副标题的颜色；
• fg:图形的前景色；
• bg:图形的背景色；

  在R中，可以通过颜色下标、颜色名称、十六进制的颜色值、RGB值或HSV值来指定颜色。例如，col=1,col="white",col="#FFFFFF",col=rgb(1,1,1)和col=hsv(0,0,1)都表示白色。

  示例代码：

dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
opar <- par(no.readonly = TRUE)
par(lty=2,pch=17,col.axis=2,fg=rgb(0,0,1),bg='gray')
plot(dose,drugA,type="b")
par(opar)

绘制的图形如下：


1.3 文本属性

  R语言图形的文本大小参数如下：

• cex:相对于默认大小缩放倍数的数值；
• cex.axis:坐标轴刻度文字的缩放倍数；
• cex.lab:坐标轴标签的缩放倍数；
• cex.main:标题的缩放倍数；
• cex.sub:副标题的缩放倍数；

  R语言图形的字体族、字号和字样的参数如下：

• font:绘图时使用的字体样式（整数，范围：1~5）；
• font.axis:坐标轴刻度文字的字体样式；
• font.lab:坐标轴标签的字体样式；
• font.main:标题的字体样式；
• font.sub:副标题的字体样式；
• ps:字体磅数（最终大小为：ps*cex）
• family:绘制文本时使用的字体族；

  示例代码：

dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
opar <- par(no.readonly = TRUE)
par(lty=2,pch=17,cex.axis=2, font.lab=4 )
plot(dose,drugA,type="b")
par(opar)

绘制的图形如下：


1.4 图形尺寸和边界大小

  R语言图形的控制图形尺寸和边界大小参数如下：

• pin:以英寸表示的图形尺寸（宽和高）；
• mai:数值向量表示边界大小，顺序为“下左上右”，单位为英寸；
• mar:数值向量表示边界大小，顺序为“下左上右”，单位为英分；

  示例代码：

dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
opar <- par(no.readonly = TRUE)
par(pin=c(3,2))
plot(dose,drugA,type="b")
par(opar)

绘制的图形如下：

   接下来的部分虽然不属于图形参数，但对于图形来说依然十分重要！为了保持叙述流畅，将沿用上面的序号。

1.5 坐标轴、标题

  R语言的图形坐标轴选项如下：

• xlab:x轴标签；
• ylab:y轴标签；
• xlim:x轴范围；
• ylim:y轴范围；

  标题选项如下：

• main:主标题；
• sub:副标题；
• title():函数，可添加坐标轴标签和标题；

  示例代码：

dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
plot(dose,drugA,type="b",
     xlab='x:dose',ylab='y:drugA',
     xlim=c(20,60),ylim=c(15,60),
     main='drugA over dose',sub='As exmaple')

绘制的图形如下：


1.6 自定义坐标轴、文本标注、参考线

  自定义坐标轴（axis）的参数如下：

• side:1=下，2=左，3=上，4=右；
• at:数值型向量，表示绘制刻度线的位置；
• labels:字符型向量，表示刻度线旁边的文字标签；
• pos:坐标轴线绘制位置的坐标；
• lty:线条类型；
• col:线条和刻度线的颜色；
• las:标签是否平行于（=0）或垂直于（=2）坐标轴
• tck:刻度线的长度；
• ...

  R语言的文本标注有text()和mtext(),其中text()可向绘图区域内部添加文本，mtext()则向图形的四个边界之一添加文本，它们的参数如下

• location:文本的位置参数，可用(x,y)坐标，也可交互式添加；
• pos:文本相对于位置参数的方位，1=下，2=左，3=上，4=右。
• side:放置文本的边，1=下，2=左，3=上，4=右；

其他常用的选项有cex,col和font(分别来调整字号、颜色和字体样式)。R语言还支持数学标注，标注语法类似于Tex.
  参考线的函数为abline(),语法为：

abline(h=yvalues, v=xvalues)

abline()中也可以指定其它图形参数，如线条类型、颜色和宽度。

  示例代码：

x <- c(1:10)
y <- x
z <- 10/x
opar <- par(no.readonly = TRUE)
if(FALSE){边界大小}
par(mar=c(5,4,4,8)+0.1)
plot(x,y,type="b",pch=21,col="red",yaxt="n",lty=3,ann = FALSE)
lines(x,z,type="b",pch=22,col="blue",lty=2)
if(FALSE){自定义坐标轴}
axis(2,at=x,labels=x,col.axis="red",las=2)
axis(4,at=z,labels=round(z,digits=2),col.axis="blue",las=2,cex.axis=0.7,tck=-0.01)
if(FALSE){文本标注}
mtext("y=10/x",side=4,line=3,cex.lab=1,las=2,col="blue")
if(FALSE){标题+坐标轴标签}
title("An Example of Creative Axes", xlab="X values",ylab="Y=X")
if(FALSE){参考线}
abline(h=seq(1,10,2), lty=2, col="blue")
par(opar)

绘制的图形如下：


1.7 图例

  R语言中的图例函数为legend(),参数如下：

• location:指定(x,y)坐标，或使用关键字（如：topleft），或交互式指定位置；
• title:图例标题的字符串（可选）；
• legend:图例标签组成的字符型向量;
• ...

其它选项还包括：指定盒子样式的bty,背景色：bg,大小:cex，文本颜色:text.col等。
  示例代码如下：

dose <- c(20,30,40,45,60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
drugB <- c(15,18,25,31,40)
opar <- par(no.readonly = TRUE)
par(lwd=2, cex=1.5, font.lab=2)
plot(dose,drugA,type="b",pch=15,lty=1,col="red",ylim=c(0,60),
     main="Drug A vs. Drug B",xlab="Drug Dosage",ylab="Drug Response")
lines(dose,drugB,type="b",pch=17,lty=2,col="blue")
legend("topleft",inset=.05,title="Drug Type",c("A","B"),lty=c(1,2),pch=c(15,17),col=c("red","blue"))
par(opar)

绘制的图形如下：


1.8图形的组合

  在R语言中，可用函数par()或layout()组合多幅图形为一幅总括图形。在par()函数中可用mfrow=c(nrows,ncols)来创建按行填充的、行数为nrows、列数为ncols的图形矩阵。layout()的调用形式为layout(mat)，其中mat为矩阵，制定了组合的多个图形的所在位置，可以跨行或跨列。

  示例代码1如下：

attach(mtcars)
opar <- par(no.readonly = TRUE)
par(mfrow=c(2,2))
plot(wt,mpg,main="scatterplot of wt vs. mpg")
plot(wt,disp,main="scatterplot of wt vs. disp")
hist(wt,main="Histogram of wt")
boxplot(wt,main="boxplot of wt")
par(opar)
detach(mtcars)

  绘制的图形如下：


  示例代码2如下：

attach(mtcars)
layout(matrix(c(1,1,2,3),2,2,byrow=TRUE),widths = c(3,1),heights = c(1,2))
hist(wt)
hist(mpg)
hist(disp)
detach(mtcars)

  绘制的图形如下：


  以上的内容参考自《R语言实战》。关于图形的设置就讲到这儿了，终于可以舒一口气了~~下面我们将尝试着自己来绘制图形

  我们将要绘制的图形来自于：http://www.runoob.com/try/try.php?filename=HighchartsTest ,这个图形使用HighCharts绘制的，我们将用R语言来绘制这个图形。代码如下：

x <- seq(1,12)
months <- c('一月','二月','三月','四月','五月','六月','七月','八月','九月','十月','十一月','十二月')
Tokyo <- c(7.0,6.9,9.5,14.5,18.2,21.5,25.2,26.5,23.3,18.3,13.9,9.6)
New_York <- c(-.2,.8,5.7,11.3,17.0,22.0,24.8,24.1,20.1,14.1,8.6,2.5)
Berlin <- c(-.9,.6,3.5,8.4,13.5,17.0,18.6,17.9,14.3,9.0,3.9,1.0)
London <- c(3.9,4.2,5.7,8.5,11.9,15.2,17.0,16.6,14.2,10.3,6.6,4.8)
opar <- par(no.readonly = TRUE)
par(bty="n")
plot(Tokyo,xaxt="n",pch=19,type="b",lwd=2,
     main="月平均气温",sub="Plotted by R Language",
     ylim=c(-10,30),col="blue",xlab="",ylab="Temperature(℃)",axes=FALSE)
lines(New_York,type="b",pch=18,col="black",lwd=2)
lines(Berlin,type="b",pch=15,col="green",lwd=2)
lines(London,type="b",pch=17,col="orange",lwd=2)
axis(2,at=seq(-10,30,10),tick=F)
axis(1,at=x,labels=months,las=2)
abline(h=c(0,10,20,30),col="gray")
legend("topright",c("Tokyo","New York","Berlin","London"),pch=c(19,18,15,17),
       col=c("blue","black","green","orange"),bty="n")
par(opar)

绘制的图形如下：


  本次分享到此结束，欢迎大家交流~~