GenBank序列名称解析

1. 分子生物学的中心法则是DNA转录成RNA然后翻译成蛋白质。

2. GenBank序列名称解析

格式:LOCUS       EU740255    728 bp              DNA  linear      VRT                    15-JUL-2008
                         locus name   sequence lenght molecule type  GenBank division  modification date 

索引号码(locus name):
GenBank/EMBL/DDBJ核酸序列记录  一个字母跟着5个数字,如X02775
                                                 两个字母跟着6个数字,如AF025334
RefSeq核酸序列记录                      两个字母,一个下划线,6个数字。如mRNA记录(NM_*);基因组DNA片段记录(NT_*)

数据文件类型:
1. PRI:灵长类(primate)
2. ROD: 啮齿类(rodent)
3. MAM: 其他哺乳类(mammalian)
4. VRT: 其他脊椎动物(vertebrate)
5. INV:非脊椎动物(invertebrate)
6. PLN: 植物、真菌和藻类
7. BCT: 细菌(bacterial)
8. VRL: 病毒(viral)
9. PHG: 噬菌体(bacteriophage)
10.SYN: 人工合成(synthetic)
11.UNA: 未经注释(unannotated)
12.EST: EST(expressed sequence tags,表达序列标签)
13.PAT: 专利( patent)
14.STS:STS(sequence-tagged sites,序列标签位点)
15.GSS:GSS(genome survey sequences,基因组测序序列)
16.HTG:HTGS(high-throughput genomic sequences,高通量基因组序列)

原文地址:https://www.cnblogs.com/frostbelt/p/1868682.html