记2018最后一次问题诊断-Spark on Yarn所有任务运行失败

  2018的最后一个工作日,是在调式和诊断问题的过程中度过,原本可以按时下班,毕竟最后一天了,然鹅,确是一直苦苦挣扎。

  废话不多说,先描述一下问题:有一套大数据环境,是CDH版本的,总共4台机子,我们的应用程序与大数据集群之前已经集成完毕,调试没有问题,可以运行Spark任务。而与这个集群集成是17年下半年的事了,这次升级后,发现无法正确的执行任务,不管是程序提交的还是用示例程序SparkPi,或者手动用spark-submit提交,都是执行失败,且Yarn框架调度执行两次。主要错误提示如下:

Diagnostics: java.lang.NoSuchMethodError: org.apache.commons.io.FileUtils.isSymlink(Ljava/io/File;)Z

截图如下:

sprak-submit提交客户端日志截图

yarn:8088任务监控页面任务(与上图不是一个任务,但错误信息一致)

  其实,从任务日志错误提示,可以看出,肯定是加载了低版本的包,用了高版本的方法,NoSuchMethod异常再也熟悉不过了,这一点确信后,就需要找这个包在哪里?FileUtils类属于commons-io包,目前有1.4和2.4版本的,其中,1,4中的FileUtils类确实没有isSymlink方法。好了,基本可以确认,程序在使用了这个commons-io-1.4.jar包。

  虽然问题确认,但是还是让人很头疼,因为我可以确认,我们自己的应用程序中,只用了2.4的包。为了排序一些常规影响,我们分别使用cdh自带的sparka提交、使用最简单的SparkPi来运行,但都运行失败,并且我还写了一个搜索类所在的包的工具,来运行排查问题。

package com.meritdata.search.tool;

import java.io.PrintStream;
import java.security.CodeSource;
import java.security.ProtectionDomain;

public class Utils
{
  public static void search(String name)
  {
    try
    {
      Class clazz = Class.forName(name);
      ProtectionDomain pd = clazz.getProtectionDomain();
      CodeSource cs = pd.getCodeSource();
      System.out.println(name + " location: " + cs.getLocation());
    }
    catch (Throwable e) {
      e.printStackTrace();
    }
  }
}
package com.meritdata.search.tool;

public class Search
{
  public static void main(String[] args)
  {
    String name = args[0];
    Utils.search(name);
  }
}

这是最先开始使用的代码,想验证当前任务加载的包是不是有其他的版本,使用提交命令:

%SPARK_HOME%>.inspark-submit.cmd --master --deploy cluster --files hive-site.xml --class com.meritdata.search.tool.Search search.tool-0.0.1-SNAPSHOT.jar org.apache.commons.io.FileUtils

这个任务运行的结果,打印的是commons-io-2.4.jar。确认后再想,是不是其他地方引用,而这个demo比较简单,没有使用到,因为加载顺序不一样,可能会影响。所以,又完善了一下程序:

package com.meritdata.search.tool;

import java.util.Collections;
import org.apache.spark.sql.Dataset;
import org.apache.spark.sql.Encoders;
import org.apache.spark.sql.SparkSession;
import org.apache.spark.sql.SparkSession.Builder;

public class SparkDemo
{
  public static void main(String[] args)
  {
    try
    {
      SparkSession spark = SparkSession.builder().appName("SparkDemo").enableHiveSupport().getOrCreate();
      Dataset dataset = spark.createDataset(Collections.singletonList("test"), Encoders.STRING());
      dataset.show();
      spark.sql("SELECT explode(Array("a", "b", "c")) as v ").show();
    } catch (Throwable e) {
      e.printStackTrace();
    }

    String name = args[0];
    Utils.search(name);
  }
}

  因为实际中,要使用spark,必须初始化SparkSession,这样运行完成spark的代码后,再看看打印的包名称。但是结果令人意外,在初始化SparkSession的时候,任务就异常了,错误信息如开头提示。这下,我终于确认,是Yarn服务加载了不该加载的jar包,这下,就要排查yarn加载的包了,除过应用自己,yarn还要加载默认的包,hadoop的,hdfs的,yarn的包,配置项为 yarn.application.classpath, 在CDH的配置界面可以搜索到,有默认配置,会加载hadoop的一些基础程序包。首先想到的是,肯定是这个路径下面加载了低版本的包,想清空试试运行,结果还不行,因为有默认值,不填写每用,后来才想到的,因为当时已经调试的懵逼了。

  发现不过后,想着去服务器上面,看看那些地方都有1.4的包,使用搜索命令:

find / -name commons-io-*.jar -type f

  搜索结果如图:

在大数据集群的某个节点搜索到的结果

  从搜索结果来看,在cdn的jars下面有个1.4的包,我想,会不会是这样包引起的呢?但是,我在其他的环境中也发现这个包,不可能是这个包引起的,要不然,都得有问题。既然这个包没有影响,任务加载的包也是正确的,哪到底是哪里的影响了任务的执行?

  此时,这个问题已经搞得人头疼,尝试了却没有发现问题,明明很简单,就包冲突,却无法解决。在领导的提示下,替换1.4中的FileUtils类,看看到底是不是这个包的问题,也不管了,只能试试了,司马当活马医。修改完成,打包,在四个节点搜索所有的1.4包,准备替换。

  突然,发现了一个让人惊喜的意外,在大数据集群的某个节点,在Hadoop的子目录,搜索到了一个1.4的包,而且不是软链接。

  从搜索结果可以看出来,在执行的时候,每个任务下临时目录会复制jar包,hadoop/lib/commons-io-1.4.jar就是这个原因,查看其他节点,均为有类似情况。毫无疑问,删除这个包,重启集群,执行demo,成功,终于松了一口气。不知道是什么原因导致,现场环境复杂,所以也没办法追究,也没有必要,问题出现,就得解决。其实,很早之前,就应该检查四个节点,这样的话,就不会在那瞎想,可以尽早的发现异常包。

  由于是客户现场,调试不方便,同事也比较辛苦,在现场的滋味,我深有体会。问题虽然简单,但是对整理的了解和调试方法也是很重要的,否则,会做很多无用功。

  仅此来纪念和告别2018的辛勤工作,2019继续奋发前行,让自己更强。

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