MPI2 编程环境搭建 MPI4PY 编程环境搭建

最近发现了一门新语言 Julia , 这门编程语言据说大有取代 Python语言成为数据科学的大佬，但是细看发现最主要说的是这门编程语言运行速度比较快，并且在分布式和并行计算上比较有优势，这时候我就在想PYTHON语言是否也可以比较容易的搭建并行计算的平台呢，这一看还真有，就是 MPI4PY，这是个基于MPI的Python并行计算框架，其实细研究发现这个东西其实就是把MPI做了一下封装，然后把Python的消息用MPI进行传递。

由于 mpi4py 是在MPI 之上进行运作的，需要先安装MPI，于是下面我们先安装MPI。

MPI 的old 版本下载地址：

http://www.mpich.org/static/downloads/

由于MPICH2的中文资料比较好找，于是本文安装MPICH2的版本，mpich2-1.0.4p1 。

mpich2-1.0.4p1

下载地址：

http://www.mpich.org/static/downloads/1.0.4p1/mpich2-1.0.4p1.tar.gz

下载后解压。

编译：

./configure --prefix=/opt/mpich2-1 --enable-f90 --enable-cxx --enable-threads=multiple --enable-sharedlibs=gcc --with-mpe

make 


sudo make install

本文的安装环境为 Ubuntu16.04， mpi的安装路径设置为 /opt/mpich2-1 。

其中，编译过程中报错，最后发现是系统中还需要安装LIB库，于是，

sudo apt install mpich

不过据网上说只需要安装 libmpich-dev 就可以，不过没有考证。

安装结束后进行设置：

在 $HOME 文件夹下面的 .bashrc 文件中添加内容：

export PATH=/opt/mpich2-1/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich2-1/lib:$LD_LIBRARY_PATH

source .bashrc 更新系统变量。

配置 mpd

cd $HOME

touch .mpd.conf

sudo chmod 600 .mpd.conf

修改内容：  vim .mpd.conf



MPD_SECRETWORD=mr45-j9z

mr45-j9z  为密码内容，  该内容可以自己随意设置。



启动  mpd

mpd &


以上为  MPICH2  安装的全部过程。




下面安装MPI4PY

sudo pip2 install mpi4py

测试， mpi4py 是否安装成果：

测试文件：

# mpi_helloworld.py

from mpi4py import MPI


comm = MPI.COMM_WORLD
size = comm.Get_size()
rank = comm.Get_rank()
node_name = MPI.Get_processor_name() # get the name of the node

print 'Hello world from process %d at %s.' % (rank, node_name)

运行：

mpiexec -n 4 python x.py

安装成功。

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MPICH2 安装成功测试：

创建文件 hello.c

#include "mpi.h"  
#include <stdio.h>  
#include <math.h>  
int main (int argc, char **argv)  
{  
int myid, numprocs;  
int namelen;  
char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];  
MPI_Init (&argc, &argv);  
MPI_Comm_rank (MPI_COMM_WORLD, &myid);  
MPI_Comm_size (MPI_COMM_WORLD, &numprocs);  
MPI_Get_processor_name (processor_name, &namelen);  
fprintf (stderr, "Hello World! Process %d of %d on %s
", myid, numprocs, processor_name);  
MPI_Finalize ();  
return 0;  
}

编译：

mpicc -o hello hello.c

执行：

mpirun -np 4 ./hello

安装成功。