分析：
有时候因为时间紧迫的原因，所以就没去管它，今天再次遇到它，实在看着不爽，所以想了办法解决此问题！
这个问题是由于eclipse中文件不同步引起的。在eclipse中，工程文件是由eclipse自动扫描添加的，如果在外部修改了工程目录中的文件但又关闭了自动刷新功能，则会引起文件不同步，从而搜索时出现Resource is out of sync with the file system问题（其它功能可能也会如此）。此外，在外部没有修改eclipse工程中的文件也有可能引起该问题。
解决方法：
有两种解决方法：
1）手动刷新。即在eclipse的工程目录中，右键refresh（或者按下F5）。
2）配置eclipse的选项：
a）eclipse启动时，刷新workspace，即勾选：window—>preferences—>general—>startup and shutdown—>refresh workspace on startup；
b）window—>preferences—>general—>workspace中：勾选选项：refresh using native hooks or polling和refresh on access；