Ubuntu16.04下配置caffe（仅CPU）
第二次配置caffe环境，依旧把之前犯过的错误重新走了一遍，不会配置的地方还是忘了，所以打算通过博客记录下来，方便以后学习使用。
1.安装依赖包
$ sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libhdf5-serial-dev protobuf-compiler
$ sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev
$ sudo apt-get install libopenblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev
$ sudo apt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev注：如果提示”安装无法定位软件包”,可以尝试sudo apt-get update命令
2.安装caffe
$ cd ~
$ git clone git://github.com/BVLC/caffe.git3.编译caffe
$ cd caffe
$ cp Makefile.config.example Makefile.config (复制一份Makefile.config文件)在Makefile.config文件中把CPU_ONLY := 1的注释给去掉，就是去掉前面的#号
接下来在caffe根目录下执行下面命令
$ make all在这个命令后，我遇到了一个报错信息，
./include/caffe/util/hdf5.hpp:6:18: fatal error: hdf5.h: No such file or directory这是hdf5路径问题造成的，可以通过下面命令来获得hdf5的路径，
$ sudo find / -name hdf5.h 我找到的hdf5.h的路径为：/usr/include/hdf5/serial/hdf5.h，于是在makefile.config文件中，把文件改成下面所示：
再执行一遍上述命令，继续报错，这次是/usr/bin/ld: cannot find -lhdf5
于是同上面一个处理 去找libhdf5.so
配置文件改为：
LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial
/usr/local/lib /usr/libINCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/include/hdf5/serial
/usr/local/include/usr/bin/ld: cannot find -lcblas
/usr/bin/ld: cannot find -latlas解决
sudo apt-get install libatlas-base-dev
其他问题：
.build_release/lib/libcaffe.so: undefined reference to `cv::imdecode(cv::_InputArray const&, int)'
collect2: error: ld returned 1 exit status
make: *** [.build_release/tools/convert_imageset.bin] Error 1
solution:
add "opencv_imgcodecs" in Makefile.(LIBRARIES += glog gflags protobuf leveldb snappy
lmdb boost_system hdf5_hl hdf5 m
opencv_core opencv_highgui opencv_imgproc opencv_imgcodecs)
将上面黄色部分放在：# PYTHON_LIBRARIES := boost_python3 python3.5m 这行前。
If you input "make all",the problem is the same again.But if you delete all the file in build(rm -rf ./build/*) before "make all"(I use make clean ),you will success.I just success
github 讨论帖：https://github.com/BVLC/caffe/issues/2348
接着执行下面命令：
make test
我这里还是会报上面错 undefined reference to cv::imread(，。。。奇怪的是后面make runtest过了。
最后，
$ make runtest
mnist测试：
参考：http://www.cnblogs.com/bigdata01/p/6886151.html
第一部分 下载mnist数据集
在data/mnist目录下执行：
./get_mnist.sh
这样下载完成了4个文件：
t10k-images-idx3-ubyte
t10k-labels-idx1-ubyte
train-images-idx3-ubyte
train-labels-idx1-ubyte
但下载的是二进制文件，需要转换为LEVELDB或LMDB才能被Caffe识别。
第二部分 数据处理
在Caffe根目录下执行：
./examples/mnist/create_mnist.sh
这样在/examples/mnist/目录下生成了两个文件夹
mnist_test_lmdb
mnist_train_lmdb
每个文件夹里面各有两个文件。
第三部分 训练（LeNet-5模型）
首选将 lenet_solver.prototxt 文件中的
# solver mode: CPU or GPU
solver_mode: GPU
改为
# solver mode: CPU or GPU
solver_mode: CPU
然后执行
./examples/mnist/train_lenet.sh
进行训练。训练结束后会生成 lenet_iter_10000.caffemodel 权值文件。
第四部分 测试
执行：
./build/tools/caffe.bin test
-model examples/mnist/lenet_train_test.prototxt
-weights examples/mnist/lenet_iter_10000.caffemodel
-iterations 100
查看预测结果。
最终结果：
I0520 19:50:40.672024 3989 caffe.cpp:318] Loss: 0.0273101
I0520 19:50:40.672076 3989 caffe.cpp:330] accuracy = 0.9918
I0520 19:50:40.672130 3989 caffe.cpp:330] loss = 0.0273101 (* 1 = 0.0273101 loss)
OK 完成。
4.编译python接口
安装pip
$ sudo apt-get install python-pip执行安装依赖
根据caffe/python目录下的requirements.txt中列出的清单安装即可。
fortran编译器（gfortran)使为了安装scipy，否则会报错。
cd ~/caffe
sudo apt-get install gfortran
cd ./python
for req in $(cat requirements.txt); do pip install $req; done回到caffe根目录
sudo pip install -r python/requirements.txt
编译pycaffe接口
make pycaffe -j8此时报错
python/caffe/_caffe.cpp:10:31: fatal error: numpy/arrayobject.h: 没有那个文件或目录
于是，输入如下命令即可
sudo apt-get install python-numpy
最后：
----------------------进入caffe /python 才可以执行其中的python脚本--------------------
zz@zz-Inspiron-5520:~$ cd caffe
zz@zz-Inspiron-5520:~/caffe$ cd python
zz@zz-Inspiron-5520:~/caffe/python$ python
>>> import caffe
应该没有任何错误。设置下环境变量即可成功安装pycaffe了。
export PYTHONPATH=/path/to/caffe/python:$PYTHONPATH
在配置过程中会遇到各种问题，各种报错，最有效的办法就是百度啦。感谢以下博客
参考博客：
http://blog.csdn.net/striker_v/article/details/51615197
http://blog.csdn.net/u011762313/article/details/47262549
http://www.cnblogs.com/xuanxufeng/p/6016945.html
附：caffe入门说明，对各个文件的解释。
参考：http://blog.csdn.net/cham_3/article/details/72141753
Caffe的几个重要文件
用了这么久Caffe都没好好写过一篇新手入门的博客，最近应实验室小师妹要求，打算写一篇简单、快熟入门的科普文。
利用Caffe进行深度神经网络训练第一步需要搞懂几个重要文件：
- solver.prototxt
- train_val.prototxt
- train.sh
接下来我们按顺序一个个说明。
solver.prototxt
solver这个文件主要存放模型训练所用到的一些超参数：
- net := 指定待训练模型结构文件，即train_val.prototxt
- test_interval := 测试间隔，即每隔多少次迭代进行一次测试
- test_initialization := 指定是否进行初始测试，即模型未进行训练时的测试
- test_iteration := 指定测试时进行的迭代次数
- base_lr := 指定基本学习率
- lr_policy := 学习率变更策略，这里有介绍，可供参考
- gamma := 学习率变更策略需要用到的参数
- power := 同上
- stepsize := 学习率变更策略Step的变更步长（固定步长）
- stepvalue := 学习率变更策略Multistep的变更步长（可变步长）
- max_iter := 模型训练的最大迭代次数
- momentum := 动量，这是优化策略（Adam, SGD, … ）用到的参数
- momentum2 := 优化策略Adam用到的参数
- weight_decay := 权重衰减率
- clip_gradients := 固定梯度范围
- display := 每隔几次迭代显示一次结果
- snapshot := 快照，每隔几次保存一次模型参数
- snapshot_prefix := 保存模型文件的前缀，可以是路径
- type := solver优化策略，即SGD、Adam、AdaGRAD、RMSProp、NESTROVE、ADADELTA等
- solver_mode := 指定训练模式，即GPU/CPU
- debug_info := 指定是否打印调试信息，这里有对启用该功能的输出作介绍
- device_id := 指定设备号（使用GPU模式），默认为0
用户根据自己的情况进行相应设置，黑体参数为必须指定的，其余参数为可选（根据情况选择）。
train_val.prototxt
train_val文件是用来存放模型结构的地方，模型的结构主要以layer为单位来构建。下面我们以LeNet为例介绍网络层的基本组成：
name: "LeNet"
layer {
name: "mnist" #网络层名称
type: "Data" #网络层类型，数据层
top: "data" #这一层的输出，数据
top: "label" #这一层的输出，标签
include { phase: TRAIN } #TRAIN:=用于训练,TEST:=用于测试
transform_param { scale: 0.00390625 } #对数据进行scale
data_param { #数据层配置
source: "examples/mnist/mnist_train_lmdb" #数据存放路径
batch_size: 64 #指定batch大小
backend: LMDB #指定数据库格式，LMDB/LevelDB
}
}
layer {
name: "mnist"
type: "Data"
top: "data"
top: "label"
include { phase: TEST }
transform_param { scale: 0.00390625 }
data_param {
source: "examples/mnist/mnist_test_lmdb"
batch_size: 100
backend: LMDB
}
}
layer{
name:"conv1"
type:"Convolution" #卷积层
bottom:"data" #上一层的输出作为输入
top:"conv1"
param{name:"conv1_w" lr_mult:1 decay_mult:1} #卷积层参数w的名称，学习率和衰减率（相对于base_lr和weight_decay的倍数）
param{name:"conv1_b" lr_mult:2 decay_mult:0} #卷积层参数b的名称，学习率和衰减率
convolution_param{
num_output:20 #卷积层输出的feature map数量
kernel_size:5 #卷积层的大小
pad:0 #卷积层的填充大小
stride:1 #进行卷积的步长
weight_filler{type:"xavier" } #参数w的初始话策略
weight_filler{type:"constant" value:0.1} #参数b的初始化策略
}
}
layer { ＃BatchNorm层，对feature map进行批规范化处理
name:"bn1"
type:"BatchNorm"
bottom:"conv1"
top:"conv1"
batch_norm_param{ use_global_stats:false} #训练时为false，测试时为true
}
layer { #池化层，即下采样层
name: "pool1"
type: "Pooling"
bottom: "conv1"
top: "pool1"
pooling_param {
pool: MAX #最大值池化，还有AVE均值池化
kernel_size: 2
stride: 2
}
}
layer {
name: "conv2"
type: "Convolution"
bottom: "pool1"
top: "conv2"
param { lr_mult: 1 }
param { lr_mult: 2 }
convolution_param {
num_output: 50
kernel_size: 5
stride: 1
weight_filler { type: "xavier" }
bias_filler { type: "constant" }
}
}
layer {
name:"bn2"
type:"BatchNorm"
bottom:"conv2"
top:"conv2"
batch_norm_param{ use_global_stats:false}
}
layer {
name: "pool2"
type: "Pooling"
bottom: "conv2"
top: "pool2"
pooling_param {
pool: MAX
kernel_size: 2
stride: 2
}
}
layer { ＃全连接层
name: "ip1"
type: "InnerProduct"
bottom: "pool2"
top: "ip1"
param { lr_mult: 1 }
param { lr_mult: 2 }
inner_product_param {
num_output: 500
weight_filler { type: "xavier" }
bias_filler { type: "constant" }
}
}
layer { #激活函数层，提供非线性能力
name: "relu1"
type: "ReLU"
bottom: "ip1"
top: "ip1"
}
layer {
name: "ip2"
type: "InnerProduct"
bottom: "ip1"
top: "ip2"
param { lr_mult: 1 }
param { lr_mult: 2 }
inner_product_param {
num_output: 10
weight_filler { type: "xavier" }
bias_filler { type: "constant" }
}
}
layer { #损失函数层
name: "prob"
type: "SoftmaxWithLoss"
bottom: "ip2"
bottom: "label"
top: "prob"
}
网络结构和超参数都设计完了，接下来就可以进行模型训练了。这里我介绍最常用的模型训练脚本，也是Caffe官方文档给的例子。
train.sh
这个脚本文件可写，可不写。每次运行需要写一样的命令，所以建议写一下。
TOOLS=/path/to/your/caffe/build/tools
GLOG_logtostderr=0 GLOG_log_dir=log/ #该行用于调用glog进行训练日志保存，使用时请把该行注释删除，否则会出错
$TOOLS/caffe train --solver=/path/to/your/solver.prototxt #--snapshot=/path/to/your/snapshot or --weights=/path/to/your/caffemodel ,snapshot和weights两者只是选一，两个参数都可以用来继续训练，区别在于是否保存solver状态- 1
- 2
- 3
数据准备
这里我们举个简单的例子，改代码是Caffe官方文档提供的，但只能用于单标签的任务，多标签得对源码进行修改。该脚本是对图片数据生成对应的lmdb文件，博主一般使用原图，即数据层类型用ImageData。
#!/usr/bin/env sh
# Create the imagenet lmdb inputs
# N.B. set the path to the imagenet train + val data dirs
set -e
EXAMPLE="" #存储路径
DATA="" #数据路径
TOOLS=/path/to/your/caffe/build/tools #caffe所在目录
TRAIN_DATA_ROOT="" #训练数据根目录
VAL_DATA_ROOT="" #测试数据根目录
# RESIZE=true to resize the images to 256x256. Leave as false if images have
# already been resized using another tool.
RESIZE=false #重新调整图片大小
if $RESIZE; then
RESIZE_HEIGHT=256
RESIZE_WIDTH=256
else
RESIZE_HEIGHT=0
RESIZE_WIDTH=0
fi
#检测路径是否存在
if [ ! -d "$TRAIN_DATA_ROOT" ]; then
echo "Error: TRAIN_DATA_ROOT is not a path to a directory: $TRAIN_DATA_ROOT"
echo "Set the TRAIN_DATA_ROOT variable in create_imagenet.sh to the path"
"where the ImageNet training data is stored."
exit 1
fi
if [ ! -d "$VAL_DATA_ROOT" ]; then
echo "Error: VAL_DATA_ROOT is not a path to a directory: $VAL_DATA_ROOT"
echo "Set the VAL_DATA_ROOT variable in create_imagenet.sh to the path"
"where the ImageNet validation data is stored."
exit 1
fi
echo "Creating train lmdb..."
GLOG_logtostderr=1 $TOOLS/convert_imageset
--resize_height=$RESIZE_HEIGHT
--resize_width=$RESIZE_WIDTH
--shuffle
$TRAIN_DATA_ROOT
$DATA/train.txt #训练图片列表，运行时请把该行注释删除，否则会出错
$EXAMPLE/mnist_train_lmdb
echo "Creating val lmdb..."
GLOG_logtostderr=1 $TOOLS/convert_imageset
--resize_height=$RESIZE_HEIGHT
--resize_width=$RESIZE_WIDTH
--shuffle
$VAL_DATA_ROOT
$DATA/val.txt
$EXAMPLE/mnist_test_lmdb
echo "Done."这样，我们就可以愉快的开始训练啦。