在NGS技术发展起来前指的是把一段DNA序列插入到大肠杆菌的基因组中，利用大肠杆菌的自我增殖和克隆达到扩增这一个DNA序列的目的。
在二代短序列高通量测序中这个插入片段体现在构建适当的DNA测序文库中，先利用超声或者酶切技术把细胞中提取出的一堆乱糟糟DNA打断后末端修复，把分叉的末端序列修平；然后跑胶挑出特定长度的DNA序列——比如400bp长度的序列，就是我们要测序的主体序列，也就是要被植入的“插入片段”。只不过在二代测序中，不是植入到大肠杆菌里，而是在插入片段的两头分别加上测序用的接头（adapter），然后进行（PCR）序列扩增，最后上机测序。
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