BWA软件

bwa,即Burrows-Wheeler-Alignment Tool

用法:

在进行 reads 的比对前,需要对 fasta 文件构建 FM-index。

BWA命令中可以分别调用这三个算法,如:aln/samse/sampe for BWA-backtrack

BWA-bactrack: 用于进行 Illumina reads 的比对。reads 的长度最大为 100bp。

参考来源:

http://www.chenlianfu.com/?p=2103

http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/181

原文地址:https://www.cnblogs.com/bio-mary/p/11647113.html