后缀数组的定义

将字符串s以所有位置开头的后缀排个序。
SA[i]：排名第i的后缀的开头。
Rank[i]：以i开头的后缀的排名。
SA与Rank其实是互逆的。

后缀数组的求法

有一种比较快的DC3可以做到O(n)，但是常数巨大，不推荐使用（除非出题人真的卡你）
所以还是老老实实用倍增吧，O(n log n)，常数比较小。
大体方法就是得到每个位置开头长度k的，再通过基数排序（双关键字桶排）得到长度为k*2的。最终得到长度为n的（多的空字符视作最小的字符）。

int sa[maxn],rk[maxn],x[maxn],d[maxn],t[maxn],h[maxn];
int cmp(int i,int j,int k){return t[i]==t[j]&&t[i+k]==t[j+k];}
void GetSA(){
	m=255;
	for(i=1;i<=n;i++) t[x[i]=s[i]]++;
	for(i=0;i<m;i++) t[i]+=t[i-1];
	for(i=n;i>=1;i--) sa[t[x[i]]--]=i;
	
	for(k=1;k<=n;k<<=1){
		int p=0;
		for(i=n-k+1;i<=n;i++) d[++p]=i;
		for(i=1;i<=n;i++) if (sa[i]>k) d[++p]=sa[i]-k;
		for(i=0;i<=m;i++) t[i]=0;
		for(i=1;i<=n;i++) t[x[i]]++;
		for(i=1;i<=m;i++) t[i]+=t[i-1];
		for(i=n;i>=1;i--) sa[t[x[d[i]]]--]=d[i];
		memcpy(t,x,sizeof(x));
		x[sa[1]]=p=1; 
		for(i=2;i<=n;i++) x[sa[i]]=cmp(sa[i],sa[i-1],k)?p:++p;
		if (p>=n) break; m=p;
	}
	for(i=1;i<=n;i++) rk[sa[i]]=i;
	for(i=1,j=0;i<=n;i++) {
		if (j) j--;
		while (s[i+j]==s[sa[rk[i]-1]+j]) j++;
		h[rk[i]]=j;
	}
}

实现的时候先将长度为1的预处理好。
排序的时候记录x[i]表示以i开头的长度为k的子串在所有子串中的大小，也就是rank，可以有两个x相等。
我们将所有的第一关键字丢到一个桶里面计数，然后按照第二关键字从大到小枚举，对于这个位置的第一关键字，如果与其他位置的第一关键字相等，但是因为第二关键字的缘故，编号自然是在这个第一关键字对应的区间中从后往前选的。
所以我们需要得到第二关键字排序的顺序，首先对于i=[n-k+1,n]，它们的第二关键字为空，先加进队列d里。
然后接下来的顺序就可以直接根据SA（因为之前已经排好了）逐个加进去了。这样就可以得到顺序了。
然后我们还需要得到新的x。同样按照新的SA的顺序去枚举，如果当前的排序与前一个不一样的话才cnt++。
实际上最后的x就是rank

后缀数组的应用

后缀数组有一个很重要的东西height[i]，表示suffix(SA[i])与suffix(SA[i-1])的最长公共前缀。
对于求这个height，我们有一个结论
$height[rank[i]]>=height[rank[i-1]]-1$
证明如下（其实随便画画图就可以得到）

设k=SA[rank[i-1]-1]，height[rank[i-1]]为suffix(k)与suffix(i-1)的最长公共前缀
如果去掉这两个字符串的开头的话，得到的就是suffix(k+1) 和 suffix(i)，显然suffix(k+1) 在suffix(i)的前面。
那么在i前的一定在suffix(k+1)和suffix(i)之间。所以这两个的前缀至少是height[rank[i-1]]-1。

所以我们只需要根据rank去求就可以了。

常规操作

求任意两个后缀i,j的最长公共前缀长度：height[rank[i]+1…rank[j]]的最小值
还有很多神奇的应用，但是我接触的不多